Protein–RNA interactions for Protein: Q6SJE0

Gfral, GDNF family receptor alpha-like, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GfralQ6SJE0 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GfralQ6SJE0 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GfralQ6SJE0 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GfralQ6SJE0 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GfralQ6SJE0 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GfralQ6SJE0 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GfralQ6SJE0 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GfralQ6SJE0 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GfralQ6SJE0 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GfralQ6SJE0 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GfralQ6SJE0 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GfralQ6SJE0 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GfralQ6SJE0 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GfralQ6SJE0 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GfralQ6SJE0 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GfralQ6SJE0 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GfralQ6SJE0 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GfralQ6SJE0 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GfralQ6SJE0 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GfralQ6SJE0 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GfralQ6SJE0 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GfralQ6SJE0 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GfralQ6SJE0 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GfralQ6SJE0 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GfralQ6SJE0 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GfralQ6SJE0 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GfralQ6SJE0 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GfralQ6SJE0 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GfralQ6SJE0 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GfralQ6SJE0 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GfralQ6SJE0 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GfralQ6SJE0 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GfralQ6SJE0 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GfralQ6SJE0 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GfralQ6SJE0 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GfralQ6SJE0 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GfralQ6SJE0 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GfralQ6SJE0 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GfralQ6SJE0 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GfralQ6SJE0 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GfralQ6SJE0 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GfralQ6SJE0 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GfralQ6SJE0 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GfralQ6SJE0 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GfralQ6SJE0 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GfralQ6SJE0 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GfralQ6SJE0 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GfralQ6SJE0 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GfralQ6SJE0 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GfralQ6SJE0 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GfralQ6SJE0 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GfralQ6SJE0 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GfralQ6SJE0 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GfralQ6SJE0 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GfralQ6SJE0 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GfralQ6SJE0 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GfralQ6SJE0 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GfralQ6SJE0 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GfralQ6SJE0 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GfralQ6SJE0 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GfralQ6SJE0 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GfralQ6SJE0 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GfralQ6SJE0 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GfralQ6SJE0 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GfralQ6SJE0 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GfralQ6SJE0 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GfralQ6SJE0 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GfralQ6SJE0 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GfralQ6SJE0 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GfralQ6SJE0 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GfralQ6SJE0 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GfralQ6SJE0 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GfralQ6SJE0 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GfralQ6SJE0 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GfralQ6SJE0 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GfralQ6SJE0 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GfralQ6SJE0 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GfralQ6SJE0 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GfralQ6SJE0 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GfralQ6SJE0 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GfralQ6SJE0 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GfralQ6SJE0 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GfralQ6SJE0 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GfralQ6SJE0 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GfralQ6SJE0 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GfralQ6SJE0 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GfralQ6SJE0 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GfralQ6SJE0 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GfralQ6SJE0 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GfralQ6SJE0 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GfralQ6SJE0 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GfralQ6SJE0 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GfralQ6SJE0 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GfralQ6SJE0 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GfralQ6SJE0 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
GfralQ6SJE0 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GfralQ6SJE0 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GfralQ6SJE0 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GfralQ6SJE0 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GfralQ6SJE0 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms