Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUU0

Ptx4, Pentraxin-4, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx4Q6RUU0 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ptx4Q6RUU0 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ptx4Q6RUU0 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ptx4Q6RUU0 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ptx4Q6RUU0 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ptx4Q6RUU0 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ptx4Q6RUU0 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ptx4Q6RUU0 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ptx4Q6RUU0 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ptx4Q6RUU0 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ptx4Q6RUU0 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ptx4Q6RUU0 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ptx4Q6RUU0 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ptx4Q6RUU0 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ptx4Q6RUU0 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ptx4Q6RUU0 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ptx4Q6RUU0 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ptx4Q6RUU0 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ptx4Q6RUU0 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ptx4Q6RUU0 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ptx4Q6RUU0 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ptx4Q6RUU0 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ptx4Q6RUU0 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ptx4Q6RUU0 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ptx4Q6RUU0 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ptx4Q6RUU0 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ptx4Q6RUU0 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ptx4Q6RUU0 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ptx4Q6RUU0 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ptx4Q6RUU0 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ptx4Q6RUU0 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ptx4Q6RUU0 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ptx4Q6RUU0 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ptx4Q6RUU0 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ptx4Q6RUU0 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ptx4Q6RUU0 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ptx4Q6RUU0 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ptx4Q6RUU0 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ptx4Q6RUU0 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ptx4Q6RUU0 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ptx4Q6RUU0 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ptx4Q6RUU0 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ptx4Q6RUU0 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ptx4Q6RUU0 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ptx4Q6RUU0 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ptx4Q6RUU0 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ptx4Q6RUU0 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ptx4Q6RUU0 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ptx4Q6RUU0 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ptx4Q6RUU0 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ptx4Q6RUU0 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ptx4Q6RUU0 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ptx4Q6RUU0 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ptx4Q6RUU0 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ptx4Q6RUU0 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ptx4Q6RUU0 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ptx4Q6RUU0 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ptx4Q6RUU0 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ptx4Q6RUU0 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ptx4Q6RUU0 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ptx4Q6RUU0 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ptx4Q6RUU0 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ptx4Q6RUU0 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ptx4Q6RUU0 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ptx4Q6RUU0 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ptx4Q6RUU0 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ptx4Q6RUU0 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ptx4Q6RUU0 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ptx4Q6RUU0 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ptx4Q6RUU0 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ptx4Q6RUU0 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ptx4Q6RUU0 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ptx4Q6RUU0 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ptx4Q6RUU0 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ptx4Q6RUU0 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ptx4Q6RUU0 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ptx4Q6RUU0 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ptx4Q6RUU0 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptx4Q6RUU0 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptx4Q6RUU0 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptx4Q6RUU0 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptx4Q6RUU0 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptx4Q6RUU0 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptx4Q6RUU0 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptx4Q6RUU0 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptx4Q6RUU0 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptx4Q6RUU0 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptx4Q6RUU0 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptx4Q6RUU0 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptx4Q6RUU0 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptx4Q6RUU0 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptx4Q6RUU0 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptx4Q6RUU0 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptx4Q6RUU0 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptx4Q6RUU0 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptx4Q6RUU0 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptx4Q6RUU0 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptx4Q6RUU0 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptx4Q6RUU0 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptx4Q6RUU0 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms