Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHP6

Lrrn2, Leucine rich repeat protein 2, neuronal, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn2Q6PHP6 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lrrn2Q6PHP6 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lrrn2Q6PHP6 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lrrn2Q6PHP6 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lrrn2Q6PHP6 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lrrn2Q6PHP6 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lrrn2Q6PHP6 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lrrn2Q6PHP6 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lrrn2Q6PHP6 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lrrn2Q6PHP6 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Lrrn2Q6PHP6 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Lrrn2Q6PHP6 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Lrrn2Q6PHP6 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Lrrn2Q6PHP6 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Lrrn2Q6PHP6 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lrrn2Q6PHP6 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lrrn2Q6PHP6 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lrrn2Q6PHP6 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lrrn2Q6PHP6 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lrrn2Q6PHP6 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lrrn2Q6PHP6 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Lrrn2Q6PHP6 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lrrn2Q6PHP6 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lrrn2Q6PHP6 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lrrn2Q6PHP6 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lrrn2Q6PHP6 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lrrn2Q6PHP6 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lrrn2Q6PHP6 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lrrn2Q6PHP6 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lrrn2Q6PHP6 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lrrn2Q6PHP6 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lrrn2Q6PHP6 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Lrrn2Q6PHP6 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrrn2Q6PHP6 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrrn2Q6PHP6 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrrn2Q6PHP6 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrrn2Q6PHP6 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrrn2Q6PHP6 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
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Lrrn2Q6PHP6 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
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Lrrn2Q6PHP6 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
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Lrrn2Q6PHP6 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrrn2Q6PHP6 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
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Lrrn2Q6PHP6 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrrn2Q6PHP6 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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Lrrn2Q6PHP6 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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Lrrn2Q6PHP6 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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Lrrn2Q6PHP6 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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Lrrn2Q6PHP6 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrrn2Q6PHP6 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrrn2Q6PHP6 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrrn2Q6PHP6 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrrn2Q6PHP6 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrrn2Q6PHP6 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrrn2Q6PHP6 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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Lrrn2Q6PHP6 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrrn2Q6PHP6 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrrn2Q6PHP6 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrrn2Q6PHP6 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrrn2Q6PHP6 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrrn2Q6PHP6 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrrn2Q6PHP6 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrrn2Q6PHP6 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrrn2Q6PHP6 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
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Lrrn2Q6PHP6 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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Lrrn2Q6PHP6 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrrn2Q6PHP6 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrrn2Q6PHP6 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrrn2Q6PHP6 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrrn2Q6PHP6 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrrn2Q6PHP6 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrrn2Q6PHP6 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrrn2Q6PHP6 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrrn2Q6PHP6 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrrn2Q6PHP6 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrrn2Q6PHP6 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrrn2Q6PHP6 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrrn2Q6PHP6 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrrn2Q6PHP6 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrrn2Q6PHP6 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms