Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFQ7

Rasa4, Ras GTPase-activating protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasa4Q6PFQ7 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rasa4Q6PFQ7 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rasa4Q6PFQ7 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rasa4Q6PFQ7 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rasa4Q6PFQ7 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rasa4Q6PFQ7 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rasa4Q6PFQ7 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rasa4Q6PFQ7 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rasa4Q6PFQ7 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rasa4Q6PFQ7 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rasa4Q6PFQ7 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rasa4Q6PFQ7 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rasa4Q6PFQ7 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rasa4Q6PFQ7 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rasa4Q6PFQ7 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rasa4Q6PFQ7 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rasa4Q6PFQ7 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rasa4Q6PFQ7 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rasa4Q6PFQ7 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rasa4Q6PFQ7 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rasa4Q6PFQ7 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rasa4Q6PFQ7 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rasa4Q6PFQ7 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rasa4Q6PFQ7 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rasa4Q6PFQ7 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rasa4Q6PFQ7 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rasa4Q6PFQ7 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rasa4Q6PFQ7 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rasa4Q6PFQ7 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rasa4Q6PFQ7 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rasa4Q6PFQ7 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rasa4Q6PFQ7 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rasa4Q6PFQ7 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rasa4Q6PFQ7 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rasa4Q6PFQ7 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rasa4Q6PFQ7 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Rasa4Q6PFQ7 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rasa4Q6PFQ7 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rasa4Q6PFQ7 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rasa4Q6PFQ7 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rasa4Q6PFQ7 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rasa4Q6PFQ7 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rasa4Q6PFQ7 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rasa4Q6PFQ7 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rasa4Q6PFQ7 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rasa4Q6PFQ7 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rasa4Q6PFQ7 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rasa4Q6PFQ7 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rasa4Q6PFQ7 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rasa4Q6PFQ7 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rasa4Q6PFQ7 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rasa4Q6PFQ7 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rasa4Q6PFQ7 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rasa4Q6PFQ7 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rasa4Q6PFQ7 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rasa4Q6PFQ7 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rasa4Q6PFQ7 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rasa4Q6PFQ7 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rasa4Q6PFQ7 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rasa4Q6PFQ7 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rasa4Q6PFQ7 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rasa4Q6PFQ7 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rasa4Q6PFQ7 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rasa4Q6PFQ7 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rasa4Q6PFQ7 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rasa4Q6PFQ7 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rasa4Q6PFQ7 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rasa4Q6PFQ7 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rasa4Q6PFQ7 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rasa4Q6PFQ7 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rasa4Q6PFQ7 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rasa4Q6PFQ7 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rasa4Q6PFQ7 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rasa4Q6PFQ7 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rasa4Q6PFQ7 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rasa4Q6PFQ7 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rasa4Q6PFQ7 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rasa4Q6PFQ7 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rasa4Q6PFQ7 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rasa4Q6PFQ7 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rasa4Q6PFQ7 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rasa4Q6PFQ7 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rasa4Q6PFQ7 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rasa4Q6PFQ7 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rasa4Q6PFQ7 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rasa4Q6PFQ7 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rasa4Q6PFQ7 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rasa4Q6PFQ7 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rasa4Q6PFQ7 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rasa4Q6PFQ7 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rasa4Q6PFQ7 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rasa4Q6PFQ7 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rasa4Q6PFQ7 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rasa4Q6PFQ7 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rasa4Q6PFQ7 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rasa4Q6PFQ7 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rasa4Q6PFQ7 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rasa4Q6PFQ7 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rasa4Q6PFQ7 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rasa4Q6PFQ7 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms