Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEM6

Gramd2b, GRAM domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gramd2bQ6PEM6 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gramd2bQ6PEM6 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gramd2bQ6PEM6 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gramd2bQ6PEM6 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gramd2bQ6PEM6 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gramd2bQ6PEM6 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gramd2bQ6PEM6 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gramd2bQ6PEM6 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gramd2bQ6PEM6 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gramd2bQ6PEM6 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gramd2bQ6PEM6 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gramd2bQ6PEM6 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gramd2bQ6PEM6 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gramd2bQ6PEM6 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gramd2bQ6PEM6 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gramd2bQ6PEM6 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gramd2bQ6PEM6 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gramd2bQ6PEM6 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gramd2bQ6PEM6 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gramd2bQ6PEM6 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gramd2bQ6PEM6 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gramd2bQ6PEM6 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gramd2bQ6PEM6 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gramd2bQ6PEM6 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gramd2bQ6PEM6 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gramd2bQ6PEM6 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gramd2bQ6PEM6 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gramd2bQ6PEM6 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gramd2bQ6PEM6 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gramd2bQ6PEM6 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gramd2bQ6PEM6 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gramd2bQ6PEM6 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gramd2bQ6PEM6 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gramd2bQ6PEM6 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gramd2bQ6PEM6 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gramd2bQ6PEM6 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gramd2bQ6PEM6 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gramd2bQ6PEM6 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gramd2bQ6PEM6 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gramd2bQ6PEM6 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gramd2bQ6PEM6 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gramd2bQ6PEM6 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gramd2bQ6PEM6 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gramd2bQ6PEM6 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gramd2bQ6PEM6 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gramd2bQ6PEM6 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gramd2bQ6PEM6 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gramd2bQ6PEM6 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gramd2bQ6PEM6 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gramd2bQ6PEM6 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gramd2bQ6PEM6 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gramd2bQ6PEM6 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gramd2bQ6PEM6 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gramd2bQ6PEM6 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gramd2bQ6PEM6 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gramd2bQ6PEM6 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gramd2bQ6PEM6 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gramd2bQ6PEM6 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gramd2bQ6PEM6 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gramd2bQ6PEM6 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gramd2bQ6PEM6 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gramd2bQ6PEM6 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gramd2bQ6PEM6 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gramd2bQ6PEM6 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gramd2bQ6PEM6 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gramd2bQ6PEM6 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gramd2bQ6PEM6 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gramd2bQ6PEM6 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gramd2bQ6PEM6 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gramd2bQ6PEM6 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gramd2bQ6PEM6 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gramd2bQ6PEM6 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gramd2bQ6PEM6 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gramd2bQ6PEM6 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gramd2bQ6PEM6 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gramd2bQ6PEM6 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gramd2bQ6PEM6 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gramd2bQ6PEM6 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gramd2bQ6PEM6 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gramd2bQ6PEM6 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gramd2bQ6PEM6 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gramd2bQ6PEM6 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gramd2bQ6PEM6 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gramd2bQ6PEM6 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gramd2bQ6PEM6 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gramd2bQ6PEM6 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gramd2bQ6PEM6 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gramd2bQ6PEM6 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gramd2bQ6PEM6 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gramd2bQ6PEM6 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gramd2bQ6PEM6 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gramd2bQ6PEM6 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gramd2bQ6PEM6 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gramd2bQ6PEM6 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gramd2bQ6PEM6 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gramd2bQ6PEM6 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gramd2bQ6PEM6 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gramd2bQ6PEM6 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gramd2bQ6PEM6 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gramd2bQ6PEM6 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms