Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDQ2

Chd4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,915 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd4Q6PDQ2 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chd4Q6PDQ2 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chd4Q6PDQ2 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chd4Q6PDQ2 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chd4Q6PDQ2 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chd4Q6PDQ2 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chd4Q6PDQ2 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chd4Q6PDQ2 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Chd4Q6PDQ2 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Chd4Q6PDQ2 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Chd4Q6PDQ2 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chd4Q6PDQ2 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chd4Q6PDQ2 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chd4Q6PDQ2 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chd4Q6PDQ2 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chd4Q6PDQ2 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chd4Q6PDQ2 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chd4Q6PDQ2 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chd4Q6PDQ2 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chd4Q6PDQ2 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chd4Q6PDQ2 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chd4Q6PDQ2 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chd4Q6PDQ2 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chd4Q6PDQ2 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chd4Q6PDQ2 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chd4Q6PDQ2 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chd4Q6PDQ2 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chd4Q6PDQ2 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chd4Q6PDQ2 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chd4Q6PDQ2 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chd4Q6PDQ2 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chd4Q6PDQ2 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chd4Q6PDQ2 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chd4Q6PDQ2 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chd4Q6PDQ2 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chd4Q6PDQ2 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chd4Q6PDQ2 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chd4Q6PDQ2 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chd4Q6PDQ2 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chd4Q6PDQ2 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chd4Q6PDQ2 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chd4Q6PDQ2 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chd4Q6PDQ2 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chd4Q6PDQ2 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chd4Q6PDQ2 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chd4Q6PDQ2 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chd4Q6PDQ2 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chd4Q6PDQ2 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chd4Q6PDQ2 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chd4Q6PDQ2 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chd4Q6PDQ2 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chd4Q6PDQ2 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chd4Q6PDQ2 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chd4Q6PDQ2 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chd4Q6PDQ2 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chd4Q6PDQ2 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chd4Q6PDQ2 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chd4Q6PDQ2 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chd4Q6PDQ2 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chd4Q6PDQ2 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chd4Q6PDQ2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chd4Q6PDQ2 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chd4Q6PDQ2 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chd4Q6PDQ2 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chd4Q6PDQ2 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chd4Q6PDQ2 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chd4Q6PDQ2 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Chd4Q6PDQ2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Chd4Q6PDQ2 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chd4Q6PDQ2 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chd4Q6PDQ2 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chd4Q6PDQ2 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chd4Q6PDQ2 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Chd4Q6PDQ2 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chd4Q6PDQ2 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chd4Q6PDQ2 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chd4Q6PDQ2 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chd4Q6PDQ2 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chd4Q6PDQ2 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chd4Q6PDQ2 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chd4Q6PDQ2 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Chd4Q6PDQ2 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chd4Q6PDQ2 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chd4Q6PDQ2 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chd4Q6PDQ2 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chd4Q6PDQ2 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chd4Q6PDQ2 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chd4Q6PDQ2 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chd4Q6PDQ2 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chd4Q6PDQ2 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chd4Q6PDQ2 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chd4Q6PDQ2 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chd4Q6PDQ2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chd4Q6PDQ2 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chd4Q6PDQ2 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chd4Q6PDQ2 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chd4Q6PDQ2 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chd4Q6PDQ2 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Chd4Q6PDQ2 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chd4Q6PDQ2 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms