Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDE8

Mfsd13a, Transmembrane protein 180, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd13aQ6PDE8 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mfsd13aQ6PDE8 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mfsd13aQ6PDE8 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mfsd13aQ6PDE8 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mfsd13aQ6PDE8 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mfsd13aQ6PDE8 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mfsd13aQ6PDE8 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mfsd13aQ6PDE8 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mfsd13aQ6PDE8 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mfsd13aQ6PDE8 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mfsd13aQ6PDE8 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mfsd13aQ6PDE8 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mfsd13aQ6PDE8 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mfsd13aQ6PDE8 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Mfsd13aQ6PDE8 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mfsd13aQ6PDE8 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mfsd13aQ6PDE8 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mfsd13aQ6PDE8 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mfsd13aQ6PDE8 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Mfsd13aQ6PDE8 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mfsd13aQ6PDE8 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mfsd13aQ6PDE8 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mfsd13aQ6PDE8 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mfsd13aQ6PDE8 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mfsd13aQ6PDE8 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mfsd13aQ6PDE8 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mfsd13aQ6PDE8 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mfsd13aQ6PDE8 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mfsd13aQ6PDE8 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Mfsd13aQ6PDE8 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Mfsd13aQ6PDE8 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mfsd13aQ6PDE8 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Mfsd13aQ6PDE8 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mfsd13aQ6PDE8 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mfsd13aQ6PDE8 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mfsd13aQ6PDE8 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mfsd13aQ6PDE8 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mfsd13aQ6PDE8 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mfsd13aQ6PDE8 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mfsd13aQ6PDE8 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Mfsd13aQ6PDE8 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mfsd13aQ6PDE8 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mfsd13aQ6PDE8 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mfsd13aQ6PDE8 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mfsd13aQ6PDE8 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mfsd13aQ6PDE8 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mfsd13aQ6PDE8 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mfsd13aQ6PDE8 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mfsd13aQ6PDE8 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mfsd13aQ6PDE8 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mfsd13aQ6PDE8 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mfsd13aQ6PDE8 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mfsd13aQ6PDE8 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mfsd13aQ6PDE8 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mfsd13aQ6PDE8 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Mfsd13aQ6PDE8 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mfsd13aQ6PDE8 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mfsd13aQ6PDE8 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mfsd13aQ6PDE8 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mfsd13aQ6PDE8 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mfsd13aQ6PDE8 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mfsd13aQ6PDE8 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mfsd13aQ6PDE8 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mfsd13aQ6PDE8 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mfsd13aQ6PDE8 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mfsd13aQ6PDE8 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mfsd13aQ6PDE8 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mfsd13aQ6PDE8 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mfsd13aQ6PDE8 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mfsd13aQ6PDE8 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mfsd13aQ6PDE8 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mfsd13aQ6PDE8 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mfsd13aQ6PDE8 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mfsd13aQ6PDE8 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mfsd13aQ6PDE8 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mfsd13aQ6PDE8 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Mfsd13aQ6PDE8 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mfsd13aQ6PDE8 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mfsd13aQ6PDE8 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Mfsd13aQ6PDE8 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mfsd13aQ6PDE8 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mfsd13aQ6PDE8 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Mfsd13aQ6PDE8 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Mfsd13aQ6PDE8 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Mfsd13aQ6PDE8 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Mfsd13aQ6PDE8 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mfsd13aQ6PDE8 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mfsd13aQ6PDE8 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mfsd13aQ6PDE8 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mfsd13aQ6PDE8 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mfsd13aQ6PDE8 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Mfsd13aQ6PDE8 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mfsd13aQ6PDE8 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mfsd13aQ6PDE8 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mfsd13aQ6PDE8 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mfsd13aQ6PDE8 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mfsd13aQ6PDE8 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mfsd13aQ6PDE8 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms