Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB60

Bhlhb9, Protein BHLHb9, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhb9Q6PB60 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bhlhb9Q6PB60 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bhlhb9Q6PB60 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bhlhb9Q6PB60 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bhlhb9Q6PB60 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bhlhb9Q6PB60 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bhlhb9Q6PB60 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bhlhb9Q6PB60 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bhlhb9Q6PB60 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bhlhb9Q6PB60 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bhlhb9Q6PB60 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bhlhb9Q6PB60 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bhlhb9Q6PB60 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bhlhb9Q6PB60 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bhlhb9Q6PB60 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bhlhb9Q6PB60 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bhlhb9Q6PB60 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bhlhb9Q6PB60 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bhlhb9Q6PB60 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bhlhb9Q6PB60 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bhlhb9Q6PB60 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bhlhb9Q6PB60 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bhlhb9Q6PB60 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bhlhb9Q6PB60 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bhlhb9Q6PB60 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bhlhb9Q6PB60 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bhlhb9Q6PB60 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bhlhb9Q6PB60 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bhlhb9Q6PB60 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bhlhb9Q6PB60 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bhlhb9Q6PB60 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bhlhb9Q6PB60 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bhlhb9Q6PB60 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bhlhb9Q6PB60 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bhlhb9Q6PB60 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bhlhb9Q6PB60 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bhlhb9Q6PB60 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Bhlhb9Q6PB60 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bhlhb9Q6PB60 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bhlhb9Q6PB60 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bhlhb9Q6PB60 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bhlhb9Q6PB60 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bhlhb9Q6PB60 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bhlhb9Q6PB60 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bhlhb9Q6PB60 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bhlhb9Q6PB60 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bhlhb9Q6PB60 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bhlhb9Q6PB60 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bhlhb9Q6PB60 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bhlhb9Q6PB60 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bhlhb9Q6PB60 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bhlhb9Q6PB60 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bhlhb9Q6PB60 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bhlhb9Q6PB60 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bhlhb9Q6PB60 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bhlhb9Q6PB60 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bhlhb9Q6PB60 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bhlhb9Q6PB60 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bhlhb9Q6PB60 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bhlhb9Q6PB60 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bhlhb9Q6PB60 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bhlhb9Q6PB60 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bhlhb9Q6PB60 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bhlhb9Q6PB60 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bhlhb9Q6PB60 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bhlhb9Q6PB60 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bhlhb9Q6PB60 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bhlhb9Q6PB60 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bhlhb9Q6PB60 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bhlhb9Q6PB60 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bhlhb9Q6PB60 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bhlhb9Q6PB60 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bhlhb9Q6PB60 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bhlhb9Q6PB60 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bhlhb9Q6PB60 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bhlhb9Q6PB60 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bhlhb9Q6PB60 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bhlhb9Q6PB60 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bhlhb9Q6PB60 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bhlhb9Q6PB60 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bhlhb9Q6PB60 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bhlhb9Q6PB60 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bhlhb9Q6PB60 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bhlhb9Q6PB60 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bhlhb9Q6PB60 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bhlhb9Q6PB60 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bhlhb9Q6PB60 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bhlhb9Q6PB60 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bhlhb9Q6PB60 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bhlhb9Q6PB60 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bhlhb9Q6PB60 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bhlhb9Q6PB60 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bhlhb9Q6PB60 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bhlhb9Q6PB60 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bhlhb9Q6PB60 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bhlhb9Q6PB60 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bhlhb9Q6PB60 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bhlhb9Q6PB60 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bhlhb9Q6PB60 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bhlhb9Q6PB60 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms