Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3A2

Frg2f1, Expressed sequence AA415398, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frg2f1Q6P3A2 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Frg2f1Q6P3A2 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Frg2f1Q6P3A2 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Frg2f1Q6P3A2 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Frg2f1Q6P3A2 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Frg2f1Q6P3A2 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Frg2f1Q6P3A2 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Frg2f1Q6P3A2 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Frg2f1Q6P3A2 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Frg2f1Q6P3A2 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Frg2f1Q6P3A2 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Frg2f1Q6P3A2 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Frg2f1Q6P3A2 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Frg2f1Q6P3A2 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Frg2f1Q6P3A2 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Frg2f1Q6P3A2 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Frg2f1Q6P3A2 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Frg2f1Q6P3A2 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Frg2f1Q6P3A2 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Frg2f1Q6P3A2 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Frg2f1Q6P3A2 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Frg2f1Q6P3A2 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Frg2f1Q6P3A2 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Frg2f1Q6P3A2 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Frg2f1Q6P3A2 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Frg2f1Q6P3A2 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Frg2f1Q6P3A2 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Frg2f1Q6P3A2 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Frg2f1Q6P3A2 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Frg2f1Q6P3A2 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Frg2f1Q6P3A2 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Frg2f1Q6P3A2 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Frg2f1Q6P3A2 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Frg2f1Q6P3A2 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Frg2f1Q6P3A2 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Frg2f1Q6P3A2 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Frg2f1Q6P3A2 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Frg2f1Q6P3A2 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Frg2f1Q6P3A2 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Frg2f1Q6P3A2 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Frg2f1Q6P3A2 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Frg2f1Q6P3A2 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Frg2f1Q6P3A2 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Frg2f1Q6P3A2 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Frg2f1Q6P3A2 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Frg2f1Q6P3A2 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Frg2f1Q6P3A2 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Frg2f1Q6P3A2 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Frg2f1Q6P3A2 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Frg2f1Q6P3A2 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Frg2f1Q6P3A2 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Frg2f1Q6P3A2 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Frg2f1Q6P3A2 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Frg2f1Q6P3A2 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Frg2f1Q6P3A2 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Frg2f1Q6P3A2 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Frg2f1Q6P3A2 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Frg2f1Q6P3A2 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Frg2f1Q6P3A2 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Frg2f1Q6P3A2 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Frg2f1Q6P3A2 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Frg2f1Q6P3A2 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Frg2f1Q6P3A2 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Frg2f1Q6P3A2 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Frg2f1Q6P3A2 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Frg2f1Q6P3A2 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Frg2f1Q6P3A2 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Frg2f1Q6P3A2 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Frg2f1Q6P3A2 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Frg2f1Q6P3A2 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Frg2f1Q6P3A2 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Frg2f1Q6P3A2 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Frg2f1Q6P3A2 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Frg2f1Q6P3A2 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Frg2f1Q6P3A2 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Frg2f1Q6P3A2 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Frg2f1Q6P3A2 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Frg2f1Q6P3A2 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Frg2f1Q6P3A2 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Frg2f1Q6P3A2 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Frg2f1Q6P3A2 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Frg2f1Q6P3A2 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Frg2f1Q6P3A2 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Frg2f1Q6P3A2 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Frg2f1Q6P3A2 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Frg2f1Q6P3A2 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Frg2f1Q6P3A2 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Frg2f1Q6P3A2 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Frg2f1Q6P3A2 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Frg2f1Q6P3A2 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Frg2f1Q6P3A2 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Frg2f1Q6P3A2 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Frg2f1Q6P3A2 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Frg2f1Q6P3A2 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Frg2f1Q6P3A2 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Frg2f1Q6P3A2 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Frg2f1Q6P3A2 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Frg2f1Q6P3A2 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Frg2f1Q6P3A2 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Frg2f1Q6P3A2 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms