Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXN1

Szrd1, SUZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Szrd1Q6NXN1 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Szrd1Q6NXN1 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Szrd1Q6NXN1 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Szrd1Q6NXN1 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Szrd1Q6NXN1 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Szrd1Q6NXN1 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Szrd1Q6NXN1 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Szrd1Q6NXN1 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Szrd1Q6NXN1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Szrd1Q6NXN1 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Szrd1Q6NXN1 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Szrd1Q6NXN1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Szrd1Q6NXN1 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Szrd1Q6NXN1 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Szrd1Q6NXN1 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Szrd1Q6NXN1 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Szrd1Q6NXN1 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Szrd1Q6NXN1 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Szrd1Q6NXN1 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Szrd1Q6NXN1 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Szrd1Q6NXN1 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Szrd1Q6NXN1 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Szrd1Q6NXN1 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Szrd1Q6NXN1 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Szrd1Q6NXN1 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Szrd1Q6NXN1 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Szrd1Q6NXN1 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Szrd1Q6NXN1 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Szrd1Q6NXN1 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Szrd1Q6NXN1 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Szrd1Q6NXN1 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Szrd1Q6NXN1 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Szrd1Q6NXN1 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Szrd1Q6NXN1 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Szrd1Q6NXN1 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Szrd1Q6NXN1 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Szrd1Q6NXN1 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Szrd1Q6NXN1 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Szrd1Q6NXN1 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Szrd1Q6NXN1 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Szrd1Q6NXN1 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Szrd1Q6NXN1 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Szrd1Q6NXN1 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Szrd1Q6NXN1 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Szrd1Q6NXN1 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Szrd1Q6NXN1 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Szrd1Q6NXN1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Szrd1Q6NXN1 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Szrd1Q6NXN1 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Szrd1Q6NXN1 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Szrd1Q6NXN1 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Szrd1Q6NXN1 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Szrd1Q6NXN1 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Szrd1Q6NXN1 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Szrd1Q6NXN1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Szrd1Q6NXN1 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Szrd1Q6NXN1 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Szrd1Q6NXN1 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Szrd1Q6NXN1 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Szrd1Q6NXN1 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Szrd1Q6NXN1 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Szrd1Q6NXN1 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Szrd1Q6NXN1 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Szrd1Q6NXN1 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Szrd1Q6NXN1 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Szrd1Q6NXN1 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Szrd1Q6NXN1 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Szrd1Q6NXN1 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Szrd1Q6NXN1 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Szrd1Q6NXN1 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Szrd1Q6NXN1 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Szrd1Q6NXN1 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Szrd1Q6NXN1 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Szrd1Q6NXN1 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Szrd1Q6NXN1 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Szrd1Q6NXN1 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Szrd1Q6NXN1 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Szrd1Q6NXN1 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Szrd1Q6NXN1 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Szrd1Q6NXN1 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Szrd1Q6NXN1 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Szrd1Q6NXN1 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Szrd1Q6NXN1 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Szrd1Q6NXN1 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Szrd1Q6NXN1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Szrd1Q6NXN1 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Szrd1Q6NXN1 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Szrd1Q6NXN1 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Szrd1Q6NXN1 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Szrd1Q6NXN1 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Szrd1Q6NXN1 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Szrd1Q6NXN1 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Szrd1Q6NXN1 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Szrd1Q6NXN1 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Szrd1Q6NXN1 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Szrd1Q6NXN1 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Szrd1Q6NXN1 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Szrd1Q6NXN1 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Szrd1Q6NXN1 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Szrd1Q6NXN1 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms