Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CltbQ6IRU5 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CltbQ6IRU5 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CltbQ6IRU5 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CltbQ6IRU5 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CltbQ6IRU5 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CltbQ6IRU5 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CltbQ6IRU5 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CltbQ6IRU5 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CltbQ6IRU5 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CltbQ6IRU5 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CltbQ6IRU5 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CltbQ6IRU5 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CltbQ6IRU5 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CltbQ6IRU5 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CltbQ6IRU5 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CltbQ6IRU5 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CltbQ6IRU5 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CltbQ6IRU5 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CltbQ6IRU5 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CltbQ6IRU5 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CltbQ6IRU5 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CltbQ6IRU5 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CltbQ6IRU5 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CltbQ6IRU5 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CltbQ6IRU5 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CltbQ6IRU5 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CltbQ6IRU5 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CltbQ6IRU5 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CltbQ6IRU5 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CltbQ6IRU5 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CltbQ6IRU5 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CltbQ6IRU5 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CltbQ6IRU5 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CltbQ6IRU5 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CltbQ6IRU5 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CltbQ6IRU5 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CltbQ6IRU5 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CltbQ6IRU5 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CltbQ6IRU5 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CltbQ6IRU5 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CltbQ6IRU5 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CltbQ6IRU5 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CltbQ6IRU5 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CltbQ6IRU5 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CltbQ6IRU5 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CltbQ6IRU5 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CltbQ6IRU5 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CltbQ6IRU5 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CltbQ6IRU5 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CltbQ6IRU5 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CltbQ6IRU5 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CltbQ6IRU5 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CltbQ6IRU5 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CltbQ6IRU5 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CltbQ6IRU5 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CltbQ6IRU5 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CltbQ6IRU5 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CltbQ6IRU5 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CltbQ6IRU5 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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CltbQ6IRU5 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CltbQ6IRU5 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CltbQ6IRU5 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CltbQ6IRU5 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CltbQ6IRU5 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CltbQ6IRU5 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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CltbQ6IRU5 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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CltbQ6IRU5 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CltbQ6IRU5 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CltbQ6IRU5 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CltbQ6IRU5 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CltbQ6IRU5 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CltbQ6IRU5 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CltbQ6IRU5 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CltbQ6IRU5 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CltbQ6IRU5 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CltbQ6IRU5 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CltbQ6IRU5 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CltbQ6IRU5 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CltbQ6IRU5 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CltbQ6IRU5 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CltbQ6IRU5 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CltbQ6IRU5 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CltbQ6IRU5 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CltbQ6IRU5 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CltbQ6IRU5 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CltbQ6IRU5 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms