Protein–RNA interactions for Protein: Q6IE28

Gm5416, Predicted gene 5416, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5416Q6IE28 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm5416Q6IE28 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm5416Q6IE28 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm5416Q6IE28 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
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Gm5416Q6IE28 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm5416Q6IE28 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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Gm5416Q6IE28 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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Gm5416Q6IE28 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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Gm5416Q6IE28 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm5416Q6IE28 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm5416Q6IE28 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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Gm5416Q6IE28 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm5416Q6IE28 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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Gm5416Q6IE28 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm5416Q6IE28 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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Gm5416Q6IE28 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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Gm5416Q6IE28 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm5416Q6IE28 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
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Gm5416Q6IE28 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm5416Q6IE28 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm5416Q6IE28 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
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Gm5416Q6IE28 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm5416Q6IE28 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm5416Q6IE28 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Gm5416Q6IE28 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm5416Q6IE28 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm5416Q6IE28 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm5416Q6IE28 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm5416Q6IE28 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm5416Q6IE28 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm5416Q6IE28 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm5416Q6IE28 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm5416Q6IE28 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm5416Q6IE28 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm5416Q6IE28 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm5416Q6IE28 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm5416Q6IE28 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm5416Q6IE28 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm5416Q6IE28 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm5416Q6IE28 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm5416Q6IE28 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm5416Q6IE28 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm5416Q6IE28 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm5416Q6IE28 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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