Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQU0

UPF0524 protein C3orf70 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6GQU0 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q6GQU0 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q6GQU0 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q6GQU0 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q6GQU0 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q6GQU0 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q6GQU0 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q6GQU0 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q6GQU0 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q6GQU0 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q6GQU0 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q6GQU0 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q6GQU0 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q6GQU0 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q6GQU0 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q6GQU0 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q6GQU0 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q6GQU0 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Q6GQU0 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q6GQU0 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q6GQU0 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q6GQU0 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q6GQU0 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q6GQU0 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q6GQU0 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Q6GQU0 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q6GQU0 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q6GQU0 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q6GQU0 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q6GQU0 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q6GQU0 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q6GQU0 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q6GQU0 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q6GQU0 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q6GQU0 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q6GQU0 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q6GQU0 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q6GQU0 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q6GQU0 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Q6GQU0 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Q6GQU0 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q6GQU0 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q6GQU0 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q6GQU0 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q6GQU0 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q6GQU0 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q6GQU0 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q6GQU0 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q6GQU0 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q6GQU0 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q6GQU0 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q6GQU0 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q6GQU0 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q6GQU0 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q6GQU0 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q6GQU0 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q6GQU0 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q6GQU0 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q6GQU0 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q6GQU0 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q6GQU0 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q6GQU0 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q6GQU0 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q6GQU0 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q6GQU0 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q6GQU0 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q6GQU0 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q6GQU0 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q6GQU0 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q6GQU0 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q6GQU0 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q6GQU0 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q6GQU0 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q6GQU0 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q6GQU0 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q6GQU0 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q6GQU0 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q6GQU0 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q6GQU0 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q6GQU0 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q6GQU0 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q6GQU0 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q6GQU0 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Q6GQU0 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Q6GQU0 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Q6GQU0 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q6GQU0 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q6GQU0 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q6GQU0 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q6GQU0 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Q6GQU0 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q6GQU0 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q6GQU0 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q6GQU0 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Q6GQU0 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q6GQU0 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q6GQU0 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q6GQU0 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q6GQU0 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q6GQU0 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
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