Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkp4Q68FH0 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkp4Q68FH0 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkp4Q68FH0 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkp4Q68FH0 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkp4Q68FH0 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkp4Q68FH0 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkp4Q68FH0 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkp4Q68FH0 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkp4Q68FH0 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkp4Q68FH0 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkp4Q68FH0 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkp4Q68FH0 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkp4Q68FH0 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkp4Q68FH0 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkp4Q68FH0 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkp4Q68FH0 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkp4Q68FH0 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkp4Q68FH0 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkp4Q68FH0 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkp4Q68FH0 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkp4Q68FH0 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkp4Q68FH0 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkp4Q68FH0 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkp4Q68FH0 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkp4Q68FH0 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkp4Q68FH0 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkp4Q68FH0 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkp4Q68FH0 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkp4Q68FH0 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkp4Q68FH0 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkp4Q68FH0 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkp4Q68FH0 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkp4Q68FH0 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkp4Q68FH0 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkp4Q68FH0 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkp4Q68FH0 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkp4Q68FH0 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkp4Q68FH0 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkp4Q68FH0 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkp4Q68FH0 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkp4Q68FH0 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkp4Q68FH0 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkp4Q68FH0 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkp4Q68FH0 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkp4Q68FH0 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkp4Q68FH0 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkp4Q68FH0 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkp4Q68FH0 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkp4Q68FH0 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkp4Q68FH0 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkp4Q68FH0 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkp4Q68FH0 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Pkp4Q68FH0 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkp4Q68FH0 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkp4Q68FH0 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkp4Q68FH0 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkp4Q68FH0 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkp4Q68FH0 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkp4Q68FH0 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkp4Q68FH0 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkp4Q68FH0 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkp4Q68FH0 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkp4Q68FH0 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkp4Q68FH0 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkp4Q68FH0 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkp4Q68FH0 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkp4Q68FH0 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkp4Q68FH0 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkp4Q68FH0 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkp4Q68FH0 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkp4Q68FH0 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkp4Q68FH0 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkp4Q68FH0 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkp4Q68FH0 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkp4Q68FH0 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkp4Q68FH0 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkp4Q68FH0 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkp4Q68FH0 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkp4Q68FH0 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkp4Q68FH0 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkp4Q68FH0 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkp4Q68FH0 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkp4Q68FH0 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkp4Q68FH0 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkp4Q68FH0 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkp4Q68FH0 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkp4Q68FH0 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkp4Q68FH0 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkp4Q68FH0 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkp4Q68FH0 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkp4Q68FH0 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkp4Q68FH0 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkp4Q68FH0 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkp4Q68FH0 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkp4Q68FH0 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkp4Q68FH0 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkp4Q68FH0 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkp4Q68FH0 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkp4Q68FH0 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms