Protein–RNA interactions for Protein: Q66JV7

Uncharacterized protein C8orf58 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q66JV7 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q66JV7 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q66JV7 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q66JV7 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Q66JV7 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q66JV7 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q66JV7 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Q66JV7 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q66JV7 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Q66JV7 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q66JV7 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q66JV7 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q66JV7 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q66JV7 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q66JV7 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q66JV7 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q66JV7 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q66JV7 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q66JV7 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q66JV7 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q66JV7 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q66JV7 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q66JV7 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q66JV7 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q66JV7 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q66JV7 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q66JV7 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q66JV7 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q66JV7 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q66JV7 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q66JV7 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q66JV7 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q66JV7 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q66JV7 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q66JV7 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q66JV7 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q66JV7 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q66JV7 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q66JV7 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q66JV7 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q66JV7 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q66JV7 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q66JV7 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q66JV7 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q66JV7 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q66JV7 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q66JV7 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q66JV7 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q66JV7 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q66JV7 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q66JV7 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Q66JV7 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q66JV7 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q66JV7 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q66JV7 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q66JV7 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q66JV7 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q66JV7 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q66JV7 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q66JV7 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q66JV7 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q66JV7 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q66JV7 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q66JV7 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q66JV7 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q66JV7 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q66JV7 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q66JV7 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q66JV7 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q66JV7 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Q66JV7 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q66JV7 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Q66JV7 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q66JV7 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q66JV7 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q66JV7 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q66JV7 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q66JV7 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q66JV7 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q66JV7 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q66JV7 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q66JV7 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q66JV7 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q66JV7 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Q66JV7 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q66JV7 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q66JV7 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q66JV7 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q66JV7 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q66JV7 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q66JV7 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q66JV7 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q66JV7 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q66JV7 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q66JV7 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q66JV7 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q66JV7 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q66JV7 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q66JV7 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q66JV7 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms