Protein–RNA interactions for Protein: Q640N4

Zfp248, Zinc finger protein 248, mousemouse

Predictions only

Length 576 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp248Q640N4 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Zfp248Q640N4 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Zfp248Q640N4 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Zfp248Q640N4 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Zfp248Q640N4 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Zfp248Q640N4 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Zfp248Q640N4 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Zfp248Q640N4 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Zfp248Q640N4 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Zfp248Q640N4 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Zfp248Q640N4 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Zfp248Q640N4 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Zfp248Q640N4 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Zfp248Q640N4 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Zfp248Q640N4 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Zfp248Q640N4 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Zfp248Q640N4 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Zfp248Q640N4 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Zfp248Q640N4 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Zfp248Q640N4 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Zfp248Q640N4 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Zfp248Q640N4 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Zfp248Q640N4 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Zfp248Q640N4 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Zfp248Q640N4 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Zfp248Q640N4 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Zfp248Q640N4 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Zfp248Q640N4 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Zfp248Q640N4 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Zfp248Q640N4 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Zfp248Q640N4 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Zfp248Q640N4 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Zfp248Q640N4 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Zfp248Q640N4 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Zfp248Q640N4 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Zfp248Q640N4 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Zfp248Q640N4 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Zfp248Q640N4 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Zfp248Q640N4 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Zfp248Q640N4 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Zfp248Q640N4 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zfp248Q640N4 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zfp248Q640N4 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zfp248Q640N4 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zfp248Q640N4 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zfp248Q640N4 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zfp248Q640N4 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zfp248Q640N4 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zfp248Q640N4 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zfp248Q640N4 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zfp248Q640N4 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zfp248Q640N4 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zfp248Q640N4 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zfp248Q640N4 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Zfp248Q640N4 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zfp248Q640N4 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zfp248Q640N4 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zfp248Q640N4 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zfp248Q640N4 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zfp248Q640N4 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zfp248Q640N4 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zfp248Q640N4 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zfp248Q640N4 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zfp248Q640N4 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zfp248Q640N4 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zfp248Q640N4 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zfp248Q640N4 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zfp248Q640N4 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zfp248Q640N4 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zfp248Q640N4 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zfp248Q640N4 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zfp248Q640N4 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zfp248Q640N4 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zfp248Q640N4 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zfp248Q640N4 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zfp248Q640N4 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zfp248Q640N4 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zfp248Q640N4 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zfp248Q640N4 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Zfp248Q640N4 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zfp248Q640N4 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Zfp248Q640N4 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zfp248Q640N4 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Zfp248Q640N4 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zfp248Q640N4 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zfp248Q640N4 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zfp248Q640N4 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zfp248Q640N4 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zfp248Q640N4 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zfp248Q640N4 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zfp248Q640N4 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zfp248Q640N4 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zfp248Q640N4 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zfp248Q640N4 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zfp248Q640N4 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zfp248Q640N4 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms