Protein–RNA interactions for Protein: Q63871

Polr2k, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, mousemouse

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2kQ63871 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Polr2kQ63871 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Polr2kQ63871 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Polr2kQ63871 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Polr2kQ63871 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Polr2kQ63871 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Polr2kQ63871 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Polr2kQ63871 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Polr2kQ63871 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Polr2kQ63871 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Polr2kQ63871 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Polr2kQ63871 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Polr2kQ63871 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Polr2kQ63871 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Polr2kQ63871 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Polr2kQ63871 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Polr2kQ63871 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Polr2kQ63871 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Polr2kQ63871 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Polr2kQ63871 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Polr2kQ63871 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Polr2kQ63871 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Polr2kQ63871 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Polr2kQ63871 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Polr2kQ63871 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Polr2kQ63871 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Polr2kQ63871 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Polr2kQ63871 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Polr2kQ63871 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Polr2kQ63871 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Polr2kQ63871 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Polr2kQ63871 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Polr2kQ63871 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Polr2kQ63871 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Polr2kQ63871 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Polr2kQ63871 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Polr2kQ63871 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Polr2kQ63871 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Polr2kQ63871 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Polr2kQ63871 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Polr2kQ63871 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Polr2kQ63871 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC12.4□□□□□ -0.43
Polr2kQ63871 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC12.4□□□□□ -0.43
Polr2kQ63871 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Polr2kQ63871 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Polr2kQ63871 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Polr2kQ63871 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Polr2kQ63871 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Polr2kQ63871 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Polr2kQ63871 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Polr2kQ63871 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Polr2kQ63871 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Polr2kQ63871 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Polr2kQ63871 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Polr2kQ63871 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Polr2kQ63871 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Polr2kQ63871 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Polr2kQ63871 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Polr2kQ63871 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Polr2kQ63871 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Polr2kQ63871 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Polr2kQ63871 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Polr2kQ63871 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Polr2kQ63871 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Polr2kQ63871 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Polr2kQ63871 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Polr2kQ63871 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Polr2kQ63871 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Polr2kQ63871 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Polr2kQ63871 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Polr2kQ63871 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Polr2kQ63871 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Polr2kQ63871 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Polr2kQ63871 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Polr2kQ63871 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Polr2kQ63871 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Polr2kQ63871 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Polr2kQ63871 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Polr2kQ63871 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Polr2kQ63871 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Polr2kQ63871 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Polr2kQ63871 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Polr2kQ63871 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Polr2kQ63871 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Polr2kQ63871 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Polr2kQ63871 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Polr2kQ63871 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Polr2kQ63871 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Polr2kQ63871 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Polr2kQ63871 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Polr2kQ63871 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Polr2kQ63871 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Polr2kQ63871 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Polr2kQ63871 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Polr2kQ63871 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Polr2kQ63871 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Polr2kQ63871 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Polr2kQ63871 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Polr2kQ63871 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Polr2kQ63871 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms