Protein–RNA interactions for Protein: Q62513

Znf260, Zinc finger protein 260, mousemouse

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Length 407 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf260Q62513 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Znf260Q62513 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Znf260Q62513 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Znf260Q62513 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Znf260Q62513 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Znf260Q62513 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Znf260Q62513 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Znf260Q62513 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Znf260Q62513 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Znf260Q62513 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Znf260Q62513 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Znf260Q62513 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Znf260Q62513 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Znf260Q62513 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Znf260Q62513 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Znf260Q62513 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Znf260Q62513 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Znf260Q62513 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Znf260Q62513 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Znf260Q62513 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Znf260Q62513 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Znf260Q62513 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Znf260Q62513 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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