Protein–RNA interactions for Protein: Q62470

Itga3, Integrin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga3Q62470 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Itga3Q62470 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Itga3Q62470 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Itga3Q62470 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Itga3Q62470 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Itga3Q62470 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Itga3Q62470 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Itga3Q62470 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Itga3Q62470 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Itga3Q62470 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Itga3Q62470 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itga3Q62470 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itga3Q62470 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itga3Q62470 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itga3Q62470 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Itga3Q62470 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itga3Q62470 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itga3Q62470 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itga3Q62470 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itga3Q62470 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itga3Q62470 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itga3Q62470 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itga3Q62470 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Itga3Q62470 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itga3Q62470 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itga3Q62470 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itga3Q62470 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itga3Q62470 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itga3Q62470 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itga3Q62470 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itga3Q62470 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itga3Q62470 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itga3Q62470 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itga3Q62470 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itga3Q62470 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itga3Q62470 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itga3Q62470 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itga3Q62470 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itga3Q62470 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itga3Q62470 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itga3Q62470 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itga3Q62470 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itga3Q62470 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itga3Q62470 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itga3Q62470 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itga3Q62470 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itga3Q62470 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itga3Q62470 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itga3Q62470 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itga3Q62470 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itga3Q62470 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itga3Q62470 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itga3Q62470 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Itga3Q62470 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itga3Q62470 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Itga3Q62470 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itga3Q62470 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itga3Q62470 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itga3Q62470 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itga3Q62470 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itga3Q62470 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itga3Q62470 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itga3Q62470 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itga3Q62470 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itga3Q62470 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itga3Q62470 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itga3Q62470 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itga3Q62470 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itga3Q62470 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itga3Q62470 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Itga3Q62470 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Itga3Q62470 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itga3Q62470 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itga3Q62470 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itga3Q62470 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itga3Q62470 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Itga3Q62470 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itga3Q62470 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itga3Q62470 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itga3Q62470 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itga3Q62470 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itga3Q62470 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itga3Q62470 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itga3Q62470 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itga3Q62470 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itga3Q62470 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itga3Q62470 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itga3Q62470 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itga3Q62470 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itga3Q62470 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itga3Q62470 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itga3Q62470 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itga3Q62470 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itga3Q62470 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itga3Q62470 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itga3Q62470 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itga3Q62470 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itga3Q62470 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Itga3Q62470 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Itga3Q62470 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.2 ms