Protein–RNA interactions for Protein: Q62442

Vamp1, Vesicle-associated membrane protein 1, mousemouse

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Length 118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp1Q62442 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vamp1Q62442 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vamp1Q62442 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vamp1Q62442 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vamp1Q62442 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vamp1Q62442 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vamp1Q62442 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Vamp1Q62442 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vamp1Q62442 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vamp1Q62442 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vamp1Q62442 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vamp1Q62442 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vamp1Q62442 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Vamp1Q62442 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vamp1Q62442 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vamp1Q62442 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vamp1Q62442 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vamp1Q62442 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vamp1Q62442 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vamp1Q62442 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vamp1Q62442 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Vamp1Q62442 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vamp1Q62442 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vamp1Q62442 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vamp1Q62442 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vamp1Q62442 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vamp1Q62442 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vamp1Q62442 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vamp1Q62442 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vamp1Q62442 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vamp1Q62442 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vamp1Q62442 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vamp1Q62442 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Vamp1Q62442 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vamp1Q62442 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vamp1Q62442 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Vamp1Q62442 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vamp1Q62442 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vamp1Q62442 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Vamp1Q62442 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vamp1Q62442 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vamp1Q62442 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vamp1Q62442 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vamp1Q62442 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vamp1Q62442 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vamp1Q62442 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vamp1Q62442 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vamp1Q62442 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vamp1Q62442 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vamp1Q62442 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vamp1Q62442 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vamp1Q62442 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vamp1Q62442 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vamp1Q62442 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vamp1Q62442 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vamp1Q62442 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vamp1Q62442 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Vamp1Q62442 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vamp1Q62442 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vamp1Q62442 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Vamp1Q62442 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Vamp1Q62442 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vamp1Q62442 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vamp1Q62442 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vamp1Q62442 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vamp1Q62442 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vamp1Q62442 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vamp1Q62442 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vamp1Q62442 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vamp1Q62442 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vamp1Q62442 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vamp1Q62442 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vamp1Q62442 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vamp1Q62442 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vamp1Q62442 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vamp1Q62442 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vamp1Q62442 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vamp1Q62442 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vamp1Q62442 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vamp1Q62442 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vamp1Q62442 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vamp1Q62442 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vamp1Q62442 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vamp1Q62442 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Vamp1Q62442 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vamp1Q62442 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vamp1Q62442 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vamp1Q62442 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vamp1Q62442 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Vamp1Q62442 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vamp1Q62442 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vamp1Q62442 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vamp1Q62442 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vamp1Q62442 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Vamp1Q62442 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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