Protein–RNA interactions for Protein: Q62440

Tle1, Transducin-like enhancer protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tle1Q62440 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tle1Q62440 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tle1Q62440 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tle1Q62440 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tle1Q62440 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tle1Q62440 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tle1Q62440 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tle1Q62440 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tle1Q62440 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tle1Q62440 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tle1Q62440 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tle1Q62440 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tle1Q62440 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tle1Q62440 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tle1Q62440 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tle1Q62440 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tle1Q62440 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tle1Q62440 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tle1Q62440 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tle1Q62440 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tle1Q62440 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tle1Q62440 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tle1Q62440 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tle1Q62440 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tle1Q62440 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tle1Q62440 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tle1Q62440 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tle1Q62440 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tle1Q62440 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tle1Q62440 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tle1Q62440 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Tle1Q62440 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tle1Q62440 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tle1Q62440 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tle1Q62440 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tle1Q62440 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tle1Q62440 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tle1Q62440 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Tle1Q62440 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tle1Q62440 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tle1Q62440 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tle1Q62440 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tle1Q62440 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tle1Q62440 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tle1Q62440 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tle1Q62440 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tle1Q62440 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tle1Q62440 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tle1Q62440 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tle1Q62440 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tle1Q62440 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tle1Q62440 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tle1Q62440 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tle1Q62440 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tle1Q62440 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tle1Q62440 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tle1Q62440 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tle1Q62440 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tle1Q62440 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tle1Q62440 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tle1Q62440 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tle1Q62440 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tle1Q62440 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tle1Q62440 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tle1Q62440 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tle1Q62440 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tle1Q62440 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tle1Q62440 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tle1Q62440 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tle1Q62440 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tle1Q62440 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tle1Q62440 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tle1Q62440 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tle1Q62440 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tle1Q62440 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tle1Q62440 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tle1Q62440 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tle1Q62440 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tle1Q62440 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tle1Q62440 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tle1Q62440 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tle1Q62440 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tle1Q62440 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tle1Q62440 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tle1Q62440 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tle1Q62440 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tle1Q62440 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tle1Q62440 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tle1Q62440 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tle1Q62440 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tle1Q62440 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tle1Q62440 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tle1Q62440 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tle1Q62440 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tle1Q62440 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tle1Q62440 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tle1Q62440 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tle1Q62440 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tle1Q62440 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tle1Q62440 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms