Protein–RNA interactions for Protein: Q62187

Ttf1, Transcription termination factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf1Q62187 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttf1Q62187 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttf1Q62187 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttf1Q62187 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttf1Q62187 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttf1Q62187 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttf1Q62187 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttf1Q62187 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttf1Q62187 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttf1Q62187 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttf1Q62187 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttf1Q62187 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttf1Q62187 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttf1Q62187 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttf1Q62187 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttf1Q62187 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttf1Q62187 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttf1Q62187 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttf1Q62187 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttf1Q62187 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttf1Q62187 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttf1Q62187 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttf1Q62187 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttf1Q62187 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttf1Q62187 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttf1Q62187 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttf1Q62187 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttf1Q62187 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttf1Q62187 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttf1Q62187 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttf1Q62187 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttf1Q62187 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttf1Q62187 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttf1Q62187 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttf1Q62187 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttf1Q62187 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttf1Q62187 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttf1Q62187 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttf1Q62187 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttf1Q62187 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttf1Q62187 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttf1Q62187 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttf1Q62187 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttf1Q62187 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttf1Q62187 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttf1Q62187 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttf1Q62187 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttf1Q62187 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttf1Q62187 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttf1Q62187 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttf1Q62187 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttf1Q62187 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttf1Q62187 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttf1Q62187 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttf1Q62187 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttf1Q62187 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttf1Q62187 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttf1Q62187 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttf1Q62187 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttf1Q62187 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttf1Q62187 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttf1Q62187 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttf1Q62187 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttf1Q62187 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttf1Q62187 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttf1Q62187 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttf1Q62187 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttf1Q62187 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttf1Q62187 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttf1Q62187 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttf1Q62187 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttf1Q62187 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttf1Q62187 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttf1Q62187 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttf1Q62187 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttf1Q62187 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttf1Q62187 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttf1Q62187 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttf1Q62187 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttf1Q62187 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttf1Q62187 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttf1Q62187 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttf1Q62187 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttf1Q62187 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttf1Q62187 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ttf1Q62187 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ttf1Q62187 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ttf1Q62187 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ttf1Q62187 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ttf1Q62187 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ttf1Q62187 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ttf1Q62187 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ttf1Q62187 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ttf1Q62187 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ttf1Q62187 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ttf1Q62187 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ttf1Q62187 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ttf1Q62187 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ttf1Q62187 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ttf1Q62187 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms