Protein–RNA interactions for Protein: Q61687

Atrx, Transcriptional regulator ATRX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrxQ61687 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AtrxQ61687 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AtrxQ61687 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AtrxQ61687 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AtrxQ61687 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AtrxQ61687 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AtrxQ61687 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AtrxQ61687 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AtrxQ61687 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AtrxQ61687 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AtrxQ61687 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AtrxQ61687 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AtrxQ61687 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AtrxQ61687 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AtrxQ61687 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AtrxQ61687 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AtrxQ61687 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AtrxQ61687 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AtrxQ61687 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AtrxQ61687 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AtrxQ61687 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AtrxQ61687 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AtrxQ61687 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AtrxQ61687 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AtrxQ61687 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AtrxQ61687 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AtrxQ61687 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AtrxQ61687 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AtrxQ61687 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AtrxQ61687 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AtrxQ61687 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AtrxQ61687 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AtrxQ61687 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AtrxQ61687 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
AtrxQ61687 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AtrxQ61687 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AtrxQ61687 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AtrxQ61687 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AtrxQ61687 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AtrxQ61687 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AtrxQ61687 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AtrxQ61687 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AtrxQ61687 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AtrxQ61687 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AtrxQ61687 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AtrxQ61687 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AtrxQ61687 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AtrxQ61687 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AtrxQ61687 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AtrxQ61687 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
AtrxQ61687 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AtrxQ61687 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AtrxQ61687 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AtrxQ61687 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AtrxQ61687 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
AtrxQ61687 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AtrxQ61687 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AtrxQ61687 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AtrxQ61687 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AtrxQ61687 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AtrxQ61687 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
AtrxQ61687 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
AtrxQ61687 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
AtrxQ61687 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
AtrxQ61687 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
AtrxQ61687 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
AtrxQ61687 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
AtrxQ61687 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
AtrxQ61687 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
AtrxQ61687 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
AtrxQ61687 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
AtrxQ61687 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
AtrxQ61687 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
AtrxQ61687 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
AtrxQ61687 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
AtrxQ61687 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
AtrxQ61687 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
AtrxQ61687 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
AtrxQ61687 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
AtrxQ61687 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
AtrxQ61687 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
AtrxQ61687 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
AtrxQ61687 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
AtrxQ61687 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
AtrxQ61687 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
AtrxQ61687 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
AtrxQ61687 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
AtrxQ61687 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
AtrxQ61687 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
AtrxQ61687 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
AtrxQ61687 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
AtrxQ61687 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
AtrxQ61687 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
AtrxQ61687 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
AtrxQ61687 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
AtrxQ61687 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
AtrxQ61687 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
AtrxQ61687 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
AtrxQ61687 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
AtrxQ61687 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms