Protein–RNA interactions for Protein: Q61457

Ccne1, G1/S-specific cyclin-E1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne1Q61457 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccne1Q61457 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccne1Q61457 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccne1Q61457 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccne1Q61457 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccne1Q61457 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccne1Q61457 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccne1Q61457 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ccne1Q61457 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ccne1Q61457 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ccne1Q61457 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccne1Q61457 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccne1Q61457 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccne1Q61457 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccne1Q61457 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccne1Q61457 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccne1Q61457 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccne1Q61457 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccne1Q61457 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccne1Q61457 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccne1Q61457 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccne1Q61457 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccne1Q61457 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccne1Q61457 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccne1Q61457 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccne1Q61457 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccne1Q61457 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccne1Q61457 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccne1Q61457 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccne1Q61457 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccne1Q61457 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccne1Q61457 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccne1Q61457 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccne1Q61457 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccne1Q61457 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccne1Q61457 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccne1Q61457 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccne1Q61457 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccne1Q61457 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccne1Q61457 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccne1Q61457 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccne1Q61457 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccne1Q61457 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccne1Q61457 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccne1Q61457 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccne1Q61457 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccne1Q61457 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccne1Q61457 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccne1Q61457 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccne1Q61457 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccne1Q61457 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccne1Q61457 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccne1Q61457 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccne1Q61457 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccne1Q61457 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccne1Q61457 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccne1Q61457 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccne1Q61457 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccne1Q61457 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccne1Q61457 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccne1Q61457 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccne1Q61457 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccne1Q61457 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccne1Q61457 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccne1Q61457 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccne1Q61457 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccne1Q61457 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccne1Q61457 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccne1Q61457 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccne1Q61457 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccne1Q61457 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccne1Q61457 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccne1Q61457 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccne1Q61457 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccne1Q61457 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccne1Q61457 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccne1Q61457 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccne1Q61457 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccne1Q61457 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccne1Q61457 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccne1Q61457 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccne1Q61457 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccne1Q61457 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccne1Q61457 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccne1Q61457 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccne1Q61457 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccne1Q61457 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccne1Q61457 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccne1Q61457 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccne1Q61457 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccne1Q61457 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccne1Q61457 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccne1Q61457 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccne1Q61457 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccne1Q61457 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccne1Q61457 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccne1Q61457 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccne1Q61457 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccne1Q61457 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccne1Q61457 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms