Protein–RNA interactions for Protein: Q61361

Bcan, Brevican core protein, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcanQ61361 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BcanQ61361 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BcanQ61361 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BcanQ61361 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BcanQ61361 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BcanQ61361 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
BcanQ61361 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BcanQ61361 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BcanQ61361 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BcanQ61361 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BcanQ61361 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BcanQ61361 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BcanQ61361 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BcanQ61361 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BcanQ61361 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
BcanQ61361 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BcanQ61361 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
BcanQ61361 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BcanQ61361 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BcanQ61361 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BcanQ61361 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BcanQ61361 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BcanQ61361 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BcanQ61361 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BcanQ61361 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BcanQ61361 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
BcanQ61361 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BcanQ61361 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BcanQ61361 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BcanQ61361 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BcanQ61361 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BcanQ61361 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BcanQ61361 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BcanQ61361 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BcanQ61361 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BcanQ61361 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BcanQ61361 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BcanQ61361 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BcanQ61361 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BcanQ61361 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BcanQ61361 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BcanQ61361 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BcanQ61361 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BcanQ61361 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BcanQ61361 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BcanQ61361 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BcanQ61361 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BcanQ61361 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BcanQ61361 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BcanQ61361 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BcanQ61361 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BcanQ61361 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BcanQ61361 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BcanQ61361 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BcanQ61361 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BcanQ61361 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BcanQ61361 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
BcanQ61361 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BcanQ61361 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BcanQ61361 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BcanQ61361 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BcanQ61361 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BcanQ61361 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BcanQ61361 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BcanQ61361 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BcanQ61361 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BcanQ61361 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BcanQ61361 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BcanQ61361 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BcanQ61361 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BcanQ61361 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BcanQ61361 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BcanQ61361 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BcanQ61361 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BcanQ61361 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BcanQ61361 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BcanQ61361 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BcanQ61361 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BcanQ61361 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BcanQ61361 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BcanQ61361 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BcanQ61361 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BcanQ61361 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
BcanQ61361 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BcanQ61361 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BcanQ61361 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BcanQ61361 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BcanQ61361 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
BcanQ61361 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BcanQ61361 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BcanQ61361 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BcanQ61361 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BcanQ61361 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BcanQ61361 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BcanQ61361 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BcanQ61361 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BcanQ61361 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BcanQ61361 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BcanQ61361 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BcanQ61361 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms