Protein–RNA interactions for Protein: Q61234

Snta1, Alpha-1-syntrophin, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snta1Q61234 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snta1Q61234 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snta1Q61234 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snta1Q61234 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snta1Q61234 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snta1Q61234 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snta1Q61234 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snta1Q61234 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snta1Q61234 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snta1Q61234 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snta1Q61234 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snta1Q61234 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snta1Q61234 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snta1Q61234 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snta1Q61234 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snta1Q61234 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snta1Q61234 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snta1Q61234 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snta1Q61234 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snta1Q61234 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snta1Q61234 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snta1Q61234 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snta1Q61234 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snta1Q61234 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snta1Q61234 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Snta1Q61234 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snta1Q61234 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snta1Q61234 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snta1Q61234 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snta1Q61234 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snta1Q61234 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snta1Q61234 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snta1Q61234 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snta1Q61234 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snta1Q61234 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snta1Q61234 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Snta1Q61234 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snta1Q61234 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snta1Q61234 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snta1Q61234 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snta1Q61234 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snta1Q61234 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snta1Q61234 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snta1Q61234 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snta1Q61234 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snta1Q61234 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snta1Q61234 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snta1Q61234 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snta1Q61234 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snta1Q61234 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snta1Q61234 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snta1Q61234 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snta1Q61234 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snta1Q61234 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snta1Q61234 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snta1Q61234 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snta1Q61234 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snta1Q61234 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snta1Q61234 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snta1Q61234 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snta1Q61234 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snta1Q61234 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snta1Q61234 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snta1Q61234 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snta1Q61234 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snta1Q61234 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snta1Q61234 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snta1Q61234 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snta1Q61234 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snta1Q61234 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snta1Q61234 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snta1Q61234 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snta1Q61234 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snta1Q61234 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snta1Q61234 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snta1Q61234 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snta1Q61234 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snta1Q61234 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Snta1Q61234 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snta1Q61234 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snta1Q61234 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snta1Q61234 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snta1Q61234 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snta1Q61234 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snta1Q61234 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snta1Q61234 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snta1Q61234 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snta1Q61234 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snta1Q61234 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snta1Q61234 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snta1Q61234 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snta1Q61234 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snta1Q61234 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snta1Q61234 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snta1Q61234 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snta1Q61234 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snta1Q61234 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snta1Q61234 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snta1Q61234 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snta1Q61234 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms