Protein–RNA interactions for Protein: Q61191

Hcfc1, Host cell factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,045 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcfc1Q61191 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hcfc1Q61191 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hcfc1Q61191 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hcfc1Q61191 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hcfc1Q61191 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hcfc1Q61191 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hcfc1Q61191 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hcfc1Q61191 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hcfc1Q61191 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hcfc1Q61191 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hcfc1Q61191 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Hcfc1Q61191 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Hcfc1Q61191 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hcfc1Q61191 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hcfc1Q61191 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hcfc1Q61191 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hcfc1Q61191 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hcfc1Q61191 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hcfc1Q61191 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hcfc1Q61191 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Hcfc1Q61191 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hcfc1Q61191 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hcfc1Q61191 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hcfc1Q61191 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hcfc1Q61191 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hcfc1Q61191 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hcfc1Q61191 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hcfc1Q61191 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hcfc1Q61191 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hcfc1Q61191 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hcfc1Q61191 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hcfc1Q61191 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hcfc1Q61191 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hcfc1Q61191 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hcfc1Q61191 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hcfc1Q61191 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hcfc1Q61191 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hcfc1Q61191 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hcfc1Q61191 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hcfc1Q61191 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Hcfc1Q61191 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Hcfc1Q61191 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hcfc1Q61191 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hcfc1Q61191 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hcfc1Q61191 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hcfc1Q61191 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hcfc1Q61191 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hcfc1Q61191 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hcfc1Q61191 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hcfc1Q61191 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hcfc1Q61191 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hcfc1Q61191 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hcfc1Q61191 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hcfc1Q61191 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hcfc1Q61191 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hcfc1Q61191 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hcfc1Q61191 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hcfc1Q61191 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hcfc1Q61191 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hcfc1Q61191 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hcfc1Q61191 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hcfc1Q61191 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hcfc1Q61191 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hcfc1Q61191 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hcfc1Q61191 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hcfc1Q61191 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hcfc1Q61191 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hcfc1Q61191 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hcfc1Q61191 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hcfc1Q61191 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hcfc1Q61191 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hcfc1Q61191 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hcfc1Q61191 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hcfc1Q61191 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hcfc1Q61191 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hcfc1Q61191 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hcfc1Q61191 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hcfc1Q61191 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hcfc1Q61191 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hcfc1Q61191 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hcfc1Q61191 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hcfc1Q61191 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hcfc1Q61191 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hcfc1Q61191 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hcfc1Q61191 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hcfc1Q61191 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hcfc1Q61191 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Hcfc1Q61191 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hcfc1Q61191 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hcfc1Q61191 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hcfc1Q61191 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hcfc1Q61191 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Hcfc1Q61191 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hcfc1Q61191 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hcfc1Q61191 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hcfc1Q61191 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hcfc1Q61191 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hcfc1Q61191 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hcfc1Q61191 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hcfc1Q61191 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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