Protein–RNA interactions for Protein: Q61107

Gbp4, Guanylate-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp4Q61107 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gbp4Q61107 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gbp4Q61107 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gbp4Q61107 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gbp4Q61107 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gbp4Q61107 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gbp4Q61107 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbp4Q61107 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbp4Q61107 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbp4Q61107 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbp4Q61107 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbp4Q61107 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbp4Q61107 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbp4Q61107 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbp4Q61107 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbp4Q61107 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbp4Q61107 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbp4Q61107 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbp4Q61107 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbp4Q61107 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbp4Q61107 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbp4Q61107 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbp4Q61107 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbp4Q61107 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbp4Q61107 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbp4Q61107 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gbp4Q61107 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gbp4Q61107 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gbp4Q61107 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gbp4Q61107 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gbp4Q61107 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gbp4Q61107 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gbp4Q61107 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gbp4Q61107 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gbp4Q61107 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gbp4Q61107 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gbp4Q61107 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gbp4Q61107 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gbp4Q61107 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gbp4Q61107 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gbp4Q61107 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gbp4Q61107 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gbp4Q61107 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gbp4Q61107 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gbp4Q61107 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gbp4Q61107 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gbp4Q61107 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gbp4Q61107 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gbp4Q61107 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gbp4Q61107 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gbp4Q61107 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gbp4Q61107 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gbp4Q61107 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gbp4Q61107 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gbp4Q61107 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Gbp4Q61107 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gbp4Q61107 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gbp4Q61107 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gbp4Q61107 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gbp4Q61107 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gbp4Q61107 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gbp4Q61107 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gbp4Q61107 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gbp4Q61107 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbp4Q61107 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbp4Q61107 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbp4Q61107 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbp4Q61107 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbp4Q61107 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbp4Q61107 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbp4Q61107 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbp4Q61107 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbp4Q61107 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbp4Q61107 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbp4Q61107 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbp4Q61107 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbp4Q61107 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbp4Q61107 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbp4Q61107 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbp4Q61107 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbp4Q61107 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gbp4Q61107 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gbp4Q61107 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gbp4Q61107 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gbp4Q61107 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gbp4Q61107 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gbp4Q61107 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gbp4Q61107 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gbp4Q61107 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gbp4Q61107 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gbp4Q61107 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gbp4Q61107 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gbp4Q61107 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gbp4Q61107 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gbp4Q61107 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gbp4Q61107 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gbp4Q61107 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gbp4Q61107 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gbp4Q61107 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gbp4Q61107 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms