Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbbp4Q60972 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbbp4Q60972 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbbp4Q60972 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbbp4Q60972 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbbp4Q60972 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbbp4Q60972 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbbp4Q60972 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbbp4Q60972 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbbp4Q60972 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbbp4Q60972 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbbp4Q60972 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbbp4Q60972 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbbp4Q60972 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbbp4Q60972 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbbp4Q60972 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbbp4Q60972 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbbp4Q60972 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbbp4Q60972 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbbp4Q60972 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbbp4Q60972 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbbp4Q60972 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbbp4Q60972 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbbp4Q60972 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbbp4Q60972 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbbp4Q60972 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbbp4Q60972 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbbp4Q60972 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbbp4Q60972 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbbp4Q60972 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbbp4Q60972 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbbp4Q60972 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbbp4Q60972 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbbp4Q60972 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbbp4Q60972 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbbp4Q60972 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbbp4Q60972 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbbp4Q60972 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbbp4Q60972 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbbp4Q60972 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbbp4Q60972 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbbp4Q60972 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbbp4Q60972 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbbp4Q60972 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbbp4Q60972 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbbp4Q60972 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbbp4Q60972 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbbp4Q60972 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbbp4Q60972 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbbp4Q60972 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbbp4Q60972 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbbp4Q60972 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbbp4Q60972 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbbp4Q60972 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbbp4Q60972 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbbp4Q60972 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbbp4Q60972 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbbp4Q60972 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbbp4Q60972 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbbp4Q60972 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbbp4Q60972 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbbp4Q60972 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbbp4Q60972 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbbp4Q60972 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbbp4Q60972 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbbp4Q60972 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbbp4Q60972 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbbp4Q60972 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbbp4Q60972 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbbp4Q60972 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbbp4Q60972 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbbp4Q60972 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbbp4Q60972 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbbp4Q60972 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbbp4Q60972 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbbp4Q60972 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbbp4Q60972 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbbp4Q60972 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbbp4Q60972 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbbp4Q60972 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbbp4Q60972 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbbp4Q60972 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbbp4Q60972 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbbp4Q60972 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbbp4Q60972 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbbp4Q60972 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbbp4Q60972 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbbp4Q60972 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbbp4Q60972 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbbp4Q60972 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbbp4Q60972 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbbp4Q60972 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbbp4Q60972 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbbp4Q60972 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbbp4Q60972 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbbp4Q60972 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rbbp4Q60972 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rbbp4Q60972 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rbbp4Q60972 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rbbp4Q60972 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms