Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Samhd1Q60710 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Samhd1Q60710 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Samhd1Q60710 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Samhd1Q60710 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Samhd1Q60710 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Samhd1Q60710 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Samhd1Q60710 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Samhd1Q60710 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Samhd1Q60710 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Samhd1Q60710 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Samhd1Q60710 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Samhd1Q60710 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Samhd1Q60710 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Samhd1Q60710 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Samhd1Q60710 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Samhd1Q60710 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Samhd1Q60710 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Samhd1Q60710 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Samhd1Q60710 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Samhd1Q60710 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Samhd1Q60710 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Samhd1Q60710 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Samhd1Q60710 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Samhd1Q60710 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Samhd1Q60710 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Samhd1Q60710 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Samhd1Q60710 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Samhd1Q60710 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Samhd1Q60710 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Samhd1Q60710 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Samhd1Q60710 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Samhd1Q60710 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Samhd1Q60710 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Samhd1Q60710 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Samhd1Q60710 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Samhd1Q60710 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Samhd1Q60710 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Samhd1Q60710 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Samhd1Q60710 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Samhd1Q60710 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Samhd1Q60710 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Samhd1Q60710 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Samhd1Q60710 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Samhd1Q60710 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Samhd1Q60710 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Samhd1Q60710 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Samhd1Q60710 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Samhd1Q60710 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Samhd1Q60710 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Samhd1Q60710 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Samhd1Q60710 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Samhd1Q60710 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Samhd1Q60710 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Samhd1Q60710 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Samhd1Q60710 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Samhd1Q60710 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Samhd1Q60710 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Samhd1Q60710 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Samhd1Q60710 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Samhd1Q60710 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Samhd1Q60710 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Samhd1Q60710 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Samhd1Q60710 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Samhd1Q60710 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Samhd1Q60710 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Samhd1Q60710 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Samhd1Q60710 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Samhd1Q60710 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Samhd1Q60710 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Samhd1Q60710 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Samhd1Q60710 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Samhd1Q60710 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Samhd1Q60710 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Samhd1Q60710 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Samhd1Q60710 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Samhd1Q60710 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Samhd1Q60710 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Samhd1Q60710 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Samhd1Q60710 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Samhd1Q60710 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Samhd1Q60710 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Samhd1Q60710 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Samhd1Q60710 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Samhd1Q60710 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Samhd1Q60710 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Samhd1Q60710 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Samhd1Q60710 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Samhd1Q60710 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Samhd1Q60710 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Samhd1Q60710 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Samhd1Q60710 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Samhd1Q60710 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Samhd1Q60710 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Samhd1Q60710 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Samhd1Q60710 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Samhd1Q60710 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Samhd1Q60710 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Samhd1Q60710 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Samhd1Q60710 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms