Protein–RNA interactions for Protein: Q60632

Nr2f1, COUP transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2f1Q60632 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nr2f1Q60632 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Nr2f1Q60632 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nr2f1Q60632 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nr2f1Q60632 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Nr2f1Q60632 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nr2f1Q60632 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nr2f1Q60632 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nr2f1Q60632 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nr2f1Q60632 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nr2f1Q60632 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nr2f1Q60632 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nr2f1Q60632 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nr2f1Q60632 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nr2f1Q60632 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nr2f1Q60632 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nr2f1Q60632 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nr2f1Q60632 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nr2f1Q60632 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nr2f1Q60632 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nr2f1Q60632 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nr2f1Q60632 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nr2f1Q60632 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nr2f1Q60632 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nr2f1Q60632 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Nr2f1Q60632 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Nr2f1Q60632 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nr2f1Q60632 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nr2f1Q60632 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nr2f1Q60632 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nr2f1Q60632 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nr2f1Q60632 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Nr2f1Q60632 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nr2f1Q60632 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nr2f1Q60632 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nr2f1Q60632 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nr2f1Q60632 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nr2f1Q60632 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nr2f1Q60632 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nr2f1Q60632 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nr2f1Q60632 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nr2f1Q60632 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr2f1Q60632 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr2f1Q60632 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr2f1Q60632 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr2f1Q60632 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr2f1Q60632 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr2f1Q60632 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr2f1Q60632 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr2f1Q60632 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr2f1Q60632 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr2f1Q60632 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr2f1Q60632 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr2f1Q60632 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr2f1Q60632 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr2f1Q60632 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr2f1Q60632 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr2f1Q60632 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr2f1Q60632 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr2f1Q60632 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr2f1Q60632 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nr2f1Q60632 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nr2f1Q60632 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nr2f1Q60632 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nr2f1Q60632 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nr2f1Q60632 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nr2f1Q60632 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nr2f1Q60632 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nr2f1Q60632 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nr2f1Q60632 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nr2f1Q60632 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nr2f1Q60632 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nr2f1Q60632 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nr2f1Q60632 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nr2f1Q60632 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nr2f1Q60632 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nr2f1Q60632 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nr2f1Q60632 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nr2f1Q60632 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nr2f1Q60632 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nr2f1Q60632 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nr2f1Q60632 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nr2f1Q60632 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nr2f1Q60632 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nr2f1Q60632 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nr2f1Q60632 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nr2f1Q60632 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nr2f1Q60632 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nr2f1Q60632 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nr2f1Q60632 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nr2f1Q60632 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nr2f1Q60632 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nr2f1Q60632 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nr2f1Q60632 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nr2f1Q60632 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nr2f1Q60632 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nr2f1Q60632 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nr2f1Q60632 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nr2f1Q60632 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nr2f1Q60632 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms