Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4D8

Slc5a6, Sodium-dependent multivitamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a6Q5U4D8 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc5a6Q5U4D8 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc5a6Q5U4D8 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc5a6Q5U4D8 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc5a6Q5U4D8 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc5a6Q5U4D8 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc5a6Q5U4D8 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc5a6Q5U4D8 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc5a6Q5U4D8 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc5a6Q5U4D8 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc5a6Q5U4D8 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc5a6Q5U4D8 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc5a6Q5U4D8 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc5a6Q5U4D8 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc5a6Q5U4D8 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc5a6Q5U4D8 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc5a6Q5U4D8 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc5a6Q5U4D8 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc5a6Q5U4D8 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc5a6Q5U4D8 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc5a6Q5U4D8 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc5a6Q5U4D8 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc5a6Q5U4D8 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc5a6Q5U4D8 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc5a6Q5U4D8 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc5a6Q5U4D8 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc5a6Q5U4D8 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc5a6Q5U4D8 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc5a6Q5U4D8 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc5a6Q5U4D8 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc5a6Q5U4D8 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc5a6Q5U4D8 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc5a6Q5U4D8 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc5a6Q5U4D8 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc5a6Q5U4D8 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc5a6Q5U4D8 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc5a6Q5U4D8 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc5a6Q5U4D8 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc5a6Q5U4D8 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc5a6Q5U4D8 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc5a6Q5U4D8 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc5a6Q5U4D8 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc5a6Q5U4D8 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc5a6Q5U4D8 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc5a6Q5U4D8 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc5a6Q5U4D8 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc5a6Q5U4D8 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc5a6Q5U4D8 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc5a6Q5U4D8 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc5a6Q5U4D8 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc5a6Q5U4D8 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc5a6Q5U4D8 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc5a6Q5U4D8 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc5a6Q5U4D8 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc5a6Q5U4D8 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc5a6Q5U4D8 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc5a6Q5U4D8 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc5a6Q5U4D8 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc5a6Q5U4D8 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc5a6Q5U4D8 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc5a6Q5U4D8 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc5a6Q5U4D8 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc5a6Q5U4D8 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc5a6Q5U4D8 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc5a6Q5U4D8 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc5a6Q5U4D8 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc5a6Q5U4D8 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc5a6Q5U4D8 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc5a6Q5U4D8 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc5a6Q5U4D8 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc5a6Q5U4D8 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc5a6Q5U4D8 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc5a6Q5U4D8 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc5a6Q5U4D8 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc5a6Q5U4D8 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc5a6Q5U4D8 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc5a6Q5U4D8 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc5a6Q5U4D8 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc5a6Q5U4D8 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc5a6Q5U4D8 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc5a6Q5U4D8 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc5a6Q5U4D8 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc5a6Q5U4D8 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc5a6Q5U4D8 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc5a6Q5U4D8 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc5a6Q5U4D8 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc5a6Q5U4D8 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc5a6Q5U4D8 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc5a6Q5U4D8 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc5a6Q5U4D8 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc5a6Q5U4D8 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc5a6Q5U4D8 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc5a6Q5U4D8 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc5a6Q5U4D8 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc5a6Q5U4D8 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc5a6Q5U4D8 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc5a6Q5U4D8 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc5a6Q5U4D8 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc5a6Q5U4D8 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc5a6Q5U4D8 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms