Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW4

Med13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 2,171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med13Q5SWW4 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Med13Q5SWW4 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Med13Q5SWW4 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Med13Q5SWW4 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Med13Q5SWW4 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Med13Q5SWW4 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Med13Q5SWW4 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Med13Q5SWW4 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Med13Q5SWW4 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Med13Q5SWW4 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Med13Q5SWW4 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Med13Q5SWW4 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Med13Q5SWW4 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Med13Q5SWW4 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Med13Q5SWW4 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Med13Q5SWW4 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Med13Q5SWW4 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Med13Q5SWW4 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Med13Q5SWW4 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Med13Q5SWW4 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Med13Q5SWW4 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Med13Q5SWW4 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Med13Q5SWW4 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Med13Q5SWW4 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Med13Q5SWW4 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Med13Q5SWW4 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Med13Q5SWW4 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Med13Q5SWW4 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Med13Q5SWW4 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Med13Q5SWW4 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Med13Q5SWW4 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Med13Q5SWW4 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Med13Q5SWW4 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Med13Q5SWW4 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Med13Q5SWW4 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Med13Q5SWW4 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Med13Q5SWW4 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Med13Q5SWW4 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Med13Q5SWW4 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Med13Q5SWW4 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Med13Q5SWW4 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Med13Q5SWW4 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Med13Q5SWW4 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Med13Q5SWW4 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Med13Q5SWW4 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Med13Q5SWW4 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Med13Q5SWW4 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Med13Q5SWW4 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Med13Q5SWW4 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Med13Q5SWW4 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Med13Q5SWW4 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Med13Q5SWW4 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Med13Q5SWW4 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Med13Q5SWW4 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Med13Q5SWW4 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Med13Q5SWW4 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Med13Q5SWW4 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Med13Q5SWW4 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Med13Q5SWW4 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Med13Q5SWW4 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Med13Q5SWW4 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Med13Q5SWW4 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Med13Q5SWW4 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Med13Q5SWW4 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Med13Q5SWW4 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Med13Q5SWW4 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Med13Q5SWW4 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Med13Q5SWW4 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Med13Q5SWW4 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Med13Q5SWW4 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Med13Q5SWW4 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Med13Q5SWW4 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Med13Q5SWW4 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Med13Q5SWW4 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Med13Q5SWW4 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Med13Q5SWW4 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Med13Q5SWW4 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Med13Q5SWW4 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Med13Q5SWW4 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Med13Q5SWW4 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Med13Q5SWW4 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Med13Q5SWW4 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Med13Q5SWW4 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Med13Q5SWW4 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Med13Q5SWW4 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Med13Q5SWW4 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Med13Q5SWW4 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Med13Q5SWW4 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Med13Q5SWW4 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Med13Q5SWW4 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Med13Q5SWW4 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Med13Q5SWW4 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Med13Q5SWW4 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Med13Q5SWW4 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Med13Q5SWW4 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Med13Q5SWW4 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Med13Q5SWW4 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Med13Q5SWW4 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Med13Q5SWW4 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Med13Q5SWW4 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms