Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tsr1Q5SWD9 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tsr1Q5SWD9 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tsr1Q5SWD9 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tsr1Q5SWD9 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tsr1Q5SWD9 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tsr1Q5SWD9 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tsr1Q5SWD9 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tsr1Q5SWD9 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tsr1Q5SWD9 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tsr1Q5SWD9 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tsr1Q5SWD9 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tsr1Q5SWD9 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tsr1Q5SWD9 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tsr1Q5SWD9 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tsr1Q5SWD9 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tsr1Q5SWD9 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tsr1Q5SWD9 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tsr1Q5SWD9 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tsr1Q5SWD9 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tsr1Q5SWD9 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tsr1Q5SWD9 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tsr1Q5SWD9 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tsr1Q5SWD9 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tsr1Q5SWD9 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tsr1Q5SWD9 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tsr1Q5SWD9 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tsr1Q5SWD9 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tsr1Q5SWD9 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Tsr1Q5SWD9 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tsr1Q5SWD9 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tsr1Q5SWD9 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tsr1Q5SWD9 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tsr1Q5SWD9 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tsr1Q5SWD9 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tsr1Q5SWD9 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tsr1Q5SWD9 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Tsr1Q5SWD9 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tsr1Q5SWD9 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tsr1Q5SWD9 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tsr1Q5SWD9 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tsr1Q5SWD9 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tsr1Q5SWD9 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tsr1Q5SWD9 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tsr1Q5SWD9 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tsr1Q5SWD9 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tsr1Q5SWD9 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tsr1Q5SWD9 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tsr1Q5SWD9 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tsr1Q5SWD9 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tsr1Q5SWD9 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tsr1Q5SWD9 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tsr1Q5SWD9 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tsr1Q5SWD9 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tsr1Q5SWD9 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tsr1Q5SWD9 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tsr1Q5SWD9 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Tsr1Q5SWD9 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tsr1Q5SWD9 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tsr1Q5SWD9 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tsr1Q5SWD9 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tsr1Q5SWD9 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tsr1Q5SWD9 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tsr1Q5SWD9 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tsr1Q5SWD9 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tsr1Q5SWD9 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tsr1Q5SWD9 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tsr1Q5SWD9 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tsr1Q5SWD9 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tsr1Q5SWD9 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tsr1Q5SWD9 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tsr1Q5SWD9 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tsr1Q5SWD9 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tsr1Q5SWD9 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tsr1Q5SWD9 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tsr1Q5SWD9 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tsr1Q5SWD9 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tsr1Q5SWD9 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tsr1Q5SWD9 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tsr1Q5SWD9 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tsr1Q5SWD9 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tsr1Q5SWD9 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tsr1Q5SWD9 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tsr1Q5SWD9 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tsr1Q5SWD9 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tsr1Q5SWD9 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tsr1Q5SWD9 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tsr1Q5SWD9 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tsr1Q5SWD9 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tsr1Q5SWD9 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tsr1Q5SWD9 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tsr1Q5SWD9 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tsr1Q5SWD9 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tsr1Q5SWD9 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tsr1Q5SWD9 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tsr1Q5SWD9 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tsr1Q5SWD9 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tsr1Q5SWD9 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tsr1Q5SWD9 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tsr1Q5SWD9 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms