Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD5

Vmn1r196, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r196Q5SVD5 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r196Q5SVD5 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r196Q5SVD5 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r196Q5SVD5 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r196Q5SVD5 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r196Q5SVD5 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r196Q5SVD5 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r196Q5SVD5 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r196Q5SVD5 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r196Q5SVD5 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r196Q5SVD5 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r196Q5SVD5 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r196Q5SVD5 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r196Q5SVD5 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r196Q5SVD5 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r196Q5SVD5 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r196Q5SVD5 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r196Q5SVD5 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r196Q5SVD5 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r196Q5SVD5 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r196Q5SVD5 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r196Q5SVD5 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r196Q5SVD5 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r196Q5SVD5 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r196Q5SVD5 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r196Q5SVD5 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r196Q5SVD5 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r196Q5SVD5 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r196Q5SVD5 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r196Q5SVD5 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r196Q5SVD5 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r196Q5SVD5 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r196Q5SVD5 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r196Q5SVD5 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r196Q5SVD5 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r196Q5SVD5 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r196Q5SVD5 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r196Q5SVD5 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r196Q5SVD5 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r196Q5SVD5 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r196Q5SVD5 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r196Q5SVD5 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r196Q5SVD5 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r196Q5SVD5 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r196Q5SVD5 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r196Q5SVD5 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r196Q5SVD5 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r196Q5SVD5 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r196Q5SVD5 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r196Q5SVD5 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r196Q5SVD5 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r196Q5SVD5 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r196Q5SVD5 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r196Q5SVD5 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r196Q5SVD5 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r196Q5SVD5 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r196Q5SVD5 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r196Q5SVD5 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r196Q5SVD5 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r196Q5SVD5 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r196Q5SVD5 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r196Q5SVD5 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r196Q5SVD5 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r196Q5SVD5 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r196Q5SVD5 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r196Q5SVD5 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r196Q5SVD5 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r196Q5SVD5 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r196Q5SVD5 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r196Q5SVD5 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r196Q5SVD5 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r196Q5SVD5 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r196Q5SVD5 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Vmn1r196Q5SVD5 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r196Q5SVD5 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r196Q5SVD5 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r196Q5SVD5 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r196Q5SVD5 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r196Q5SVD5 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r196Q5SVD5 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r196Q5SVD5 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r196Q5SVD5 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r196Q5SVD5 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r196Q5SVD5 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r196Q5SVD5 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r196Q5SVD5 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r196Q5SVD5 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r196Q5SVD5 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r196Q5SVD5 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r196Q5SVD5 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r196Q5SVD5 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r196Q5SVD5 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r196Q5SVD5 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r196Q5SVD5 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r196Q5SVD5 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r196Q5SVD5 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r196Q5SVD5 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r196Q5SVD5 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms