Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSM3

Arhgap44, Rho GTPase-activating protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap44Q5SSM3 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Arhgap44Q5SSM3 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Arhgap44Q5SSM3 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Arhgap44Q5SSM3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Arhgap44Q5SSM3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Arhgap44Q5SSM3 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Arhgap44Q5SSM3 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Arhgap44Q5SSM3 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Arhgap44Q5SSM3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Arhgap44Q5SSM3 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Arhgap44Q5SSM3 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Arhgap44Q5SSM3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Arhgap44Q5SSM3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Arhgap44Q5SSM3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Arhgap44Q5SSM3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Arhgap44Q5SSM3 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Arhgap44Q5SSM3 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Arhgap44Q5SSM3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Arhgap44Q5SSM3 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Arhgap44Q5SSM3 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Arhgap44Q5SSM3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Arhgap44Q5SSM3 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Arhgap44Q5SSM3 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Arhgap44Q5SSM3 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Arhgap44Q5SSM3 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Arhgap44Q5SSM3 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Arhgap44Q5SSM3 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Arhgap44Q5SSM3 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Arhgap44Q5SSM3 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Arhgap44Q5SSM3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Arhgap44Q5SSM3 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Arhgap44Q5SSM3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Arhgap44Q5SSM3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Arhgap44Q5SSM3 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Arhgap44Q5SSM3 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Arhgap44Q5SSM3 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Arhgap44Q5SSM3 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Arhgap44Q5SSM3 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Arhgap44Q5SSM3 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Arhgap44Q5SSM3 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Arhgap44Q5SSM3 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Arhgap44Q5SSM3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Arhgap44Q5SSM3 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Arhgap44Q5SSM3 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Arhgap44Q5SSM3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Arhgap44Q5SSM3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Arhgap44Q5SSM3 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Arhgap44Q5SSM3 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Arhgap44Q5SSM3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Arhgap44Q5SSM3 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Arhgap44Q5SSM3 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Arhgap44Q5SSM3 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Arhgap44Q5SSM3 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Arhgap44Q5SSM3 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Arhgap44Q5SSM3 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Arhgap44Q5SSM3 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Arhgap44Q5SSM3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Arhgap44Q5SSM3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Arhgap44Q5SSM3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Arhgap44Q5SSM3 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Arhgap44Q5SSM3 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Arhgap44Q5SSM3 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Arhgap44Q5SSM3 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Arhgap44Q5SSM3 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Arhgap44Q5SSM3 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Arhgap44Q5SSM3 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Arhgap44Q5SSM3 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Arhgap44Q5SSM3 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Arhgap44Q5SSM3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Arhgap44Q5SSM3 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Arhgap44Q5SSM3 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Arhgap44Q5SSM3 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Arhgap44Q5SSM3 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Arhgap44Q5SSM3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Arhgap44Q5SSM3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Arhgap44Q5SSM3 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Arhgap44Q5SSM3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Arhgap44Q5SSM3 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Arhgap44Q5SSM3 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Arhgap44Q5SSM3 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Arhgap44Q5SSM3 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Arhgap44Q5SSM3 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Arhgap44Q5SSM3 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Arhgap44Q5SSM3 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Arhgap44Q5SSM3 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Arhgap44Q5SSM3 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Arhgap44Q5SSM3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Arhgap44Q5SSM3 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Arhgap44Q5SSM3 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arhgap44Q5SSM3 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arhgap44Q5SSM3 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arhgap44Q5SSM3 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arhgap44Q5SSM3 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arhgap44Q5SSM3 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arhgap44Q5SSM3 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arhgap44Q5SSM3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arhgap44Q5SSM3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arhgap44Q5SSM3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arhgap44Q5SSM3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Arhgap44Q5SSM3 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms