Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1I4

Trav6-2, T cell receptor alpha variable 6-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav6-2Q5R1I4 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trav6-2Q5R1I4 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trav6-2Q5R1I4 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trav6-2Q5R1I4 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trav6-2Q5R1I4 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trav6-2Q5R1I4 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trav6-2Q5R1I4 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trav6-2Q5R1I4 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trav6-2Q5R1I4 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trav6-2Q5R1I4 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trav6-2Q5R1I4 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trav6-2Q5R1I4 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trav6-2Q5R1I4 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trav6-2Q5R1I4 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trav6-2Q5R1I4 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Trav6-2Q5R1I4 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trav6-2Q5R1I4 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trav6-2Q5R1I4 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trav6-2Q5R1I4 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trav6-2Q5R1I4 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trav6-2Q5R1I4 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trav6-2Q5R1I4 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trav6-2Q5R1I4 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Trav6-2Q5R1I4 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trav6-2Q5R1I4 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Trav6-2Q5R1I4 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trav6-2Q5R1I4 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trav6-2Q5R1I4 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trav6-2Q5R1I4 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trav6-2Q5R1I4 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trav6-2Q5R1I4 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trav6-2Q5R1I4 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trav6-2Q5R1I4 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trav6-2Q5R1I4 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trav6-2Q5R1I4 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trav6-2Q5R1I4 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trav6-2Q5R1I4 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Trav6-2Q5R1I4 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trav6-2Q5R1I4 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trav6-2Q5R1I4 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trav6-2Q5R1I4 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trav6-2Q5R1I4 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trav6-2Q5R1I4 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trav6-2Q5R1I4 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trav6-2Q5R1I4 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trav6-2Q5R1I4 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trav6-2Q5R1I4 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trav6-2Q5R1I4 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trav6-2Q5R1I4 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trav6-2Q5R1I4 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trav6-2Q5R1I4 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trav6-2Q5R1I4 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trav6-2Q5R1I4 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trav6-2Q5R1I4 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trav6-2Q5R1I4 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trav6-2Q5R1I4 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trav6-2Q5R1I4 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trav6-2Q5R1I4 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Trav6-2Q5R1I4 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trav6-2Q5R1I4 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trav6-2Q5R1I4 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trav6-2Q5R1I4 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trav6-2Q5R1I4 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trav6-2Q5R1I4 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trav6-2Q5R1I4 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trav6-2Q5R1I4 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trav6-2Q5R1I4 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Trav6-2Q5R1I4 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trav6-2Q5R1I4 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trav6-2Q5R1I4 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trav6-2Q5R1I4 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trav6-2Q5R1I4 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trav6-2Q5R1I4 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trav6-2Q5R1I4 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trav6-2Q5R1I4 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trav6-2Q5R1I4 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trav6-2Q5R1I4 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trav6-2Q5R1I4 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trav6-2Q5R1I4 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trav6-2Q5R1I4 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trav6-2Q5R1I4 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trav6-2Q5R1I4 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trav6-2Q5R1I4 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trav6-2Q5R1I4 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trav6-2Q5R1I4 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trav6-2Q5R1I4 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trav6-2Q5R1I4 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trav6-2Q5R1I4 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trav6-2Q5R1I4 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trav6-2Q5R1I4 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trav6-2Q5R1I4 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trav6-2Q5R1I4 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trav6-2Q5R1I4 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trav6-2Q5R1I4 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trav6-2Q5R1I4 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Trav6-2Q5R1I4 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Trav6-2Q5R1I4 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trav6-2Q5R1I4 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trav6-2Q5R1I4 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trav6-2Q5R1I4 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms