Protein–RNA interactions for Protein: Q5ND29

Rilp, Rab-interacting lysosomal protein, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RilpQ5ND29 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RilpQ5ND29 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RilpQ5ND29 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RilpQ5ND29 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RilpQ5ND29 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RilpQ5ND29 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
RilpQ5ND29 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RilpQ5ND29 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RilpQ5ND29 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RilpQ5ND29 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RilpQ5ND29 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RilpQ5ND29 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RilpQ5ND29 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RilpQ5ND29 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RilpQ5ND29 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RilpQ5ND29 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RilpQ5ND29 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RilpQ5ND29 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RilpQ5ND29 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RilpQ5ND29 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RilpQ5ND29 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RilpQ5ND29 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RilpQ5ND29 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RilpQ5ND29 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RilpQ5ND29 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RilpQ5ND29 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RilpQ5ND29 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RilpQ5ND29 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RilpQ5ND29 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RilpQ5ND29 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RilpQ5ND29 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RilpQ5ND29 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RilpQ5ND29 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RilpQ5ND29 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RilpQ5ND29 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RilpQ5ND29 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RilpQ5ND29 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RilpQ5ND29 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RilpQ5ND29 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RilpQ5ND29 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RilpQ5ND29 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RilpQ5ND29 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
RilpQ5ND29 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RilpQ5ND29 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RilpQ5ND29 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RilpQ5ND29 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RilpQ5ND29 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RilpQ5ND29 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RilpQ5ND29 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RilpQ5ND29 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RilpQ5ND29 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RilpQ5ND29 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RilpQ5ND29 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RilpQ5ND29 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RilpQ5ND29 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RilpQ5ND29 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RilpQ5ND29 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RilpQ5ND29 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RilpQ5ND29 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RilpQ5ND29 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RilpQ5ND29 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RilpQ5ND29 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RilpQ5ND29 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RilpQ5ND29 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RilpQ5ND29 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RilpQ5ND29 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RilpQ5ND29 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RilpQ5ND29 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RilpQ5ND29 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RilpQ5ND29 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RilpQ5ND29 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RilpQ5ND29 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RilpQ5ND29 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RilpQ5ND29 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RilpQ5ND29 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RilpQ5ND29 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RilpQ5ND29 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RilpQ5ND29 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RilpQ5ND29 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RilpQ5ND29 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RilpQ5ND29 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RilpQ5ND29 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RilpQ5ND29 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RilpQ5ND29 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RilpQ5ND29 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RilpQ5ND29 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RilpQ5ND29 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RilpQ5ND29 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RilpQ5ND29 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RilpQ5ND29 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RilpQ5ND29 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RilpQ5ND29 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RilpQ5ND29 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RilpQ5ND29 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RilpQ5ND29 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RilpQ5ND29 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RilpQ5ND29 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RilpQ5ND29 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RilpQ5ND29 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RilpQ5ND29 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms