Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZG4

Taf3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf3Q5HZG4 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Taf3Q5HZG4 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Taf3Q5HZG4 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Taf3Q5HZG4 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Taf3Q5HZG4 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Taf3Q5HZG4 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Taf3Q5HZG4 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Taf3Q5HZG4 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Taf3Q5HZG4 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Taf3Q5HZG4 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Taf3Q5HZG4 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Taf3Q5HZG4 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Taf3Q5HZG4 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Taf3Q5HZG4 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Taf3Q5HZG4 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Taf3Q5HZG4 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Taf3Q5HZG4 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Taf3Q5HZG4 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Taf3Q5HZG4 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Taf3Q5HZG4 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Taf3Q5HZG4 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Taf3Q5HZG4 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Taf3Q5HZG4 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Taf3Q5HZG4 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Taf3Q5HZG4 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Taf3Q5HZG4 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Taf3Q5HZG4 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Taf3Q5HZG4 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Taf3Q5HZG4 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Taf3Q5HZG4 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Taf3Q5HZG4 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Taf3Q5HZG4 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Taf3Q5HZG4 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Taf3Q5HZG4 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Taf3Q5HZG4 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Taf3Q5HZG4 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Taf3Q5HZG4 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Taf3Q5HZG4 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Taf3Q5HZG4 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Taf3Q5HZG4 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Taf3Q5HZG4 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Taf3Q5HZG4 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Taf3Q5HZG4 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Taf3Q5HZG4 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Taf3Q5HZG4 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Taf3Q5HZG4 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Taf3Q5HZG4 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Taf3Q5HZG4 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Taf3Q5HZG4 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Taf3Q5HZG4 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Taf3Q5HZG4 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Taf3Q5HZG4 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Taf3Q5HZG4 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Taf3Q5HZG4 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Taf3Q5HZG4 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Taf3Q5HZG4 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Taf3Q5HZG4 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Taf3Q5HZG4 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Taf3Q5HZG4 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Taf3Q5HZG4 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Taf3Q5HZG4 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Taf3Q5HZG4 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Taf3Q5HZG4 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Taf3Q5HZG4 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Taf3Q5HZG4 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Taf3Q5HZG4 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Taf3Q5HZG4 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Taf3Q5HZG4 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Taf3Q5HZG4 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Taf3Q5HZG4 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Taf3Q5HZG4 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Taf3Q5HZG4 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Taf3Q5HZG4 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Taf3Q5HZG4 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Taf3Q5HZG4 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Taf3Q5HZG4 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Taf3Q5HZG4 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Taf3Q5HZG4 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Taf3Q5HZG4 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Taf3Q5HZG4 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Taf3Q5HZG4 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Taf3Q5HZG4 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Taf3Q5HZG4 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Taf3Q5HZG4 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Taf3Q5HZG4 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Taf3Q5HZG4 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Taf3Q5HZG4 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Taf3Q5HZG4 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Taf3Q5HZG4 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Taf3Q5HZG4 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Taf3Q5HZG4 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Taf3Q5HZG4 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Taf3Q5HZG4 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Taf3Q5HZG4 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Taf3Q5HZG4 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Taf3Q5HZG4 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Taf3Q5HZG4 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Taf3Q5HZG4 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Taf3Q5HZG4 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Taf3Q5HZG4 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms