Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU56

Nlrc3, Protein NLRC3, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc3Q5DU56 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nlrc3Q5DU56 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nlrc3Q5DU56 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nlrc3Q5DU56 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nlrc3Q5DU56 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nlrc3Q5DU56 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nlrc3Q5DU56 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nlrc3Q5DU56 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nlrc3Q5DU56 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nlrc3Q5DU56 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nlrc3Q5DU56 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nlrc3Q5DU56 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nlrc3Q5DU56 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nlrc3Q5DU56 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nlrc3Q5DU56 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nlrc3Q5DU56 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nlrc3Q5DU56 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nlrc3Q5DU56 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nlrc3Q5DU56 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nlrc3Q5DU56 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nlrc3Q5DU56 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nlrc3Q5DU56 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nlrc3Q5DU56 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nlrc3Q5DU56 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nlrc3Q5DU56 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nlrc3Q5DU56 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nlrc3Q5DU56 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nlrc3Q5DU56 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nlrc3Q5DU56 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nlrc3Q5DU56 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nlrc3Q5DU56 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nlrc3Q5DU56 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nlrc3Q5DU56 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nlrc3Q5DU56 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nlrc3Q5DU56 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nlrc3Q5DU56 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nlrc3Q5DU56 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nlrc3Q5DU56 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nlrc3Q5DU56 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nlrc3Q5DU56 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nlrc3Q5DU56 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nlrc3Q5DU56 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nlrc3Q5DU56 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nlrc3Q5DU56 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nlrc3Q5DU56 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nlrc3Q5DU56 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nlrc3Q5DU56 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nlrc3Q5DU56 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nlrc3Q5DU56 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nlrc3Q5DU56 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nlrc3Q5DU56 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nlrc3Q5DU56 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nlrc3Q5DU56 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nlrc3Q5DU56 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nlrc3Q5DU56 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nlrc3Q5DU56 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nlrc3Q5DU56 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nlrc3Q5DU56 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nlrc3Q5DU56 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nlrc3Q5DU56 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nlrc3Q5DU56 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nlrc3Q5DU56 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nlrc3Q5DU56 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nlrc3Q5DU56 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nlrc3Q5DU56 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nlrc3Q5DU56 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nlrc3Q5DU56 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nlrc3Q5DU56 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nlrc3Q5DU56 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nlrc3Q5DU56 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nlrc3Q5DU56 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nlrc3Q5DU56 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nlrc3Q5DU56 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nlrc3Q5DU56 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nlrc3Q5DU56 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nlrc3Q5DU56 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nlrc3Q5DU56 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nlrc3Q5DU56 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nlrc3Q5DU56 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nlrc3Q5DU56 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nlrc3Q5DU56 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nlrc3Q5DU56 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nlrc3Q5DU56 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nlrc3Q5DU56 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nlrc3Q5DU56 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nlrc3Q5DU56 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nlrc3Q5DU56 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nlrc3Q5DU56 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nlrc3Q5DU56 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nlrc3Q5DU56 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nlrc3Q5DU56 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nlrc3Q5DU56 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nlrc3Q5DU56 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nlrc3Q5DU56 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nlrc3Q5DU56 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nlrc3Q5DU56 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nlrc3Q5DU56 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nlrc3Q5DU56 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nlrc3Q5DU56 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nlrc3Q5DU56 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms