Protein–RNA interactions for Protein: Q58FA4

E2f8, Transcription factor E2F8, mousemouse

Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f8Q58FA4 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
E2f8Q58FA4 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
E2f8Q58FA4 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
E2f8Q58FA4 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
E2f8Q58FA4 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
E2f8Q58FA4 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
E2f8Q58FA4 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
E2f8Q58FA4 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
E2f8Q58FA4 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
E2f8Q58FA4 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
E2f8Q58FA4 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
E2f8Q58FA4 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
E2f8Q58FA4 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
E2f8Q58FA4 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
E2f8Q58FA4 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
E2f8Q58FA4 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
E2f8Q58FA4 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
E2f8Q58FA4 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
E2f8Q58FA4 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
E2f8Q58FA4 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
E2f8Q58FA4 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
E2f8Q58FA4 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
E2f8Q58FA4 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
E2f8Q58FA4 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
E2f8Q58FA4 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
E2f8Q58FA4 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
E2f8Q58FA4 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
E2f8Q58FA4 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
E2f8Q58FA4 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
E2f8Q58FA4 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
E2f8Q58FA4 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
E2f8Q58FA4 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
E2f8Q58FA4 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
E2f8Q58FA4 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
E2f8Q58FA4 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
E2f8Q58FA4 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
E2f8Q58FA4 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
E2f8Q58FA4 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
E2f8Q58FA4 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
E2f8Q58FA4 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
E2f8Q58FA4 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
E2f8Q58FA4 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
E2f8Q58FA4 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
E2f8Q58FA4 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
E2f8Q58FA4 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
E2f8Q58FA4 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
E2f8Q58FA4 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
E2f8Q58FA4 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
E2f8Q58FA4 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
E2f8Q58FA4 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
E2f8Q58FA4 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
E2f8Q58FA4 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
E2f8Q58FA4 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
E2f8Q58FA4 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
E2f8Q58FA4 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
E2f8Q58FA4 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
E2f8Q58FA4 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
E2f8Q58FA4 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
E2f8Q58FA4 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
E2f8Q58FA4 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
E2f8Q58FA4 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
E2f8Q58FA4 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
E2f8Q58FA4 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
E2f8Q58FA4 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
E2f8Q58FA4 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
E2f8Q58FA4 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
E2f8Q58FA4 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
E2f8Q58FA4 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
E2f8Q58FA4 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
E2f8Q58FA4 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
E2f8Q58FA4 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
E2f8Q58FA4 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
E2f8Q58FA4 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
E2f8Q58FA4 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
E2f8Q58FA4 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
E2f8Q58FA4 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
E2f8Q58FA4 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
E2f8Q58FA4 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
E2f8Q58FA4 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
E2f8Q58FA4 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
E2f8Q58FA4 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
E2f8Q58FA4 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
E2f8Q58FA4 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
E2f8Q58FA4 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
E2f8Q58FA4 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
E2f8Q58FA4 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
E2f8Q58FA4 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
E2f8Q58FA4 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
E2f8Q58FA4 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
E2f8Q58FA4 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
E2f8Q58FA4 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
E2f8Q58FA4 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
E2f8Q58FA4 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
E2f8Q58FA4 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
E2f8Q58FA4 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
E2f8Q58FA4 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
E2f8Q58FA4 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
E2f8Q58FA4 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
E2f8Q58FA4 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
E2f8Q58FA4 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms