Protein–RNA interactions for Protein: Q4V9W2

Srek1ip1, Protein SREK1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srek1ip1Q4V9W2 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srek1ip1Q4V9W2 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srek1ip1Q4V9W2 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srek1ip1Q4V9W2 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srek1ip1Q4V9W2 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srek1ip1Q4V9W2 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srek1ip1Q4V9W2 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srek1ip1Q4V9W2 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srek1ip1Q4V9W2 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srek1ip1Q4V9W2 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srek1ip1Q4V9W2 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srek1ip1Q4V9W2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Srek1ip1Q4V9W2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srek1ip1Q4V9W2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srek1ip1Q4V9W2 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srek1ip1Q4V9W2 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srek1ip1Q4V9W2 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srek1ip1Q4V9W2 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srek1ip1Q4V9W2 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srek1ip1Q4V9W2 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srek1ip1Q4V9W2 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srek1ip1Q4V9W2 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srek1ip1Q4V9W2 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Srek1ip1Q4V9W2 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srek1ip1Q4V9W2 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srek1ip1Q4V9W2 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Srek1ip1Q4V9W2 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Srek1ip1Q4V9W2 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Srek1ip1Q4V9W2 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Srek1ip1Q4V9W2 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Srek1ip1Q4V9W2 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Srek1ip1Q4V9W2 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Srek1ip1Q4V9W2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Srek1ip1Q4V9W2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Srek1ip1Q4V9W2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Srek1ip1Q4V9W2 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Srek1ip1Q4V9W2 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Srek1ip1Q4V9W2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Srek1ip1Q4V9W2 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Srek1ip1Q4V9W2 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Srek1ip1Q4V9W2 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Srek1ip1Q4V9W2 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Srek1ip1Q4V9W2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Srek1ip1Q4V9W2 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Srek1ip1Q4V9W2 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Srek1ip1Q4V9W2 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Srek1ip1Q4V9W2 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Srek1ip1Q4V9W2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Srek1ip1Q4V9W2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Srek1ip1Q4V9W2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Srek1ip1Q4V9W2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Srek1ip1Q4V9W2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Srek1ip1Q4V9W2 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Srek1ip1Q4V9W2 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Srek1ip1Q4V9W2 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Srek1ip1Q4V9W2 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Srek1ip1Q4V9W2 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Srek1ip1Q4V9W2 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Srek1ip1Q4V9W2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Srek1ip1Q4V9W2 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Srek1ip1Q4V9W2 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Srek1ip1Q4V9W2 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Srek1ip1Q4V9W2 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Srek1ip1Q4V9W2 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Srek1ip1Q4V9W2 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Srek1ip1Q4V9W2 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Srek1ip1Q4V9W2 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Srek1ip1Q4V9W2 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Srek1ip1Q4V9W2 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Srek1ip1Q4V9W2 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Srek1ip1Q4V9W2 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Srek1ip1Q4V9W2 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Srek1ip1Q4V9W2 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Srek1ip1Q4V9W2 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Srek1ip1Q4V9W2 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Srek1ip1Q4V9W2 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Srek1ip1Q4V9W2 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Srek1ip1Q4V9W2 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Srek1ip1Q4V9W2 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Srek1ip1Q4V9W2 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Srek1ip1Q4V9W2 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Srek1ip1Q4V9W2 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Srek1ip1Q4V9W2 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Srek1ip1Q4V9W2 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Srek1ip1Q4V9W2 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Srek1ip1Q4V9W2 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Srek1ip1Q4V9W2 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Srek1ip1Q4V9W2 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Srek1ip1Q4V9W2 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Srek1ip1Q4V9W2 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Srek1ip1Q4V9W2 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Srek1ip1Q4V9W2 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Srek1ip1Q4V9W2 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Srek1ip1Q4V9W2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Srek1ip1Q4V9W2 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Srek1ip1Q4V9W2 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Srek1ip1Q4V9W2 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Srek1ip1Q4V9W2 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Srek1ip1Q4V9W2 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Srek1ip1Q4V9W2 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms