Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ulk4Q3V129 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ulk4Q3V129 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ulk4Q3V129 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Ulk4Q3V129 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ulk4Q3V129 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ulk4Q3V129 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ulk4Q3V129 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ulk4Q3V129 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ulk4Q3V129 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ulk4Q3V129 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ulk4Q3V129 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ulk4Q3V129 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ulk4Q3V129 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ulk4Q3V129 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ulk4Q3V129 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ulk4Q3V129 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ulk4Q3V129 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ulk4Q3V129 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ulk4Q3V129 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ulk4Q3V129 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ulk4Q3V129 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ulk4Q3V129 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ulk4Q3V129 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ulk4Q3V129 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ulk4Q3V129 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ulk4Q3V129 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ulk4Q3V129 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Ulk4Q3V129 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ulk4Q3V129 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ulk4Q3V129 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ulk4Q3V129 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ulk4Q3V129 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ulk4Q3V129 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ulk4Q3V129 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ulk4Q3V129 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ulk4Q3V129 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ulk4Q3V129 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Ulk4Q3V129 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Ulk4Q3V129 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ulk4Q3V129 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ulk4Q3V129 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ulk4Q3V129 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ulk4Q3V129 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ulk4Q3V129 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ulk4Q3V129 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ulk4Q3V129 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ulk4Q3V129 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ulk4Q3V129 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ulk4Q3V129 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ulk4Q3V129 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ulk4Q3V129 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ulk4Q3V129 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ulk4Q3V129 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ulk4Q3V129 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ulk4Q3V129 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ulk4Q3V129 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ulk4Q3V129 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ulk4Q3V129 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ulk4Q3V129 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ulk4Q3V129 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ulk4Q3V129 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Ulk4Q3V129 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Ulk4Q3V129 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ulk4Q3V129 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ulk4Q3V129 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ulk4Q3V129 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ulk4Q3V129 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ulk4Q3V129 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ulk4Q3V129 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ulk4Q3V129 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Ulk4Q3V129 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ulk4Q3V129 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ulk4Q3V129 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ulk4Q3V129 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ulk4Q3V129 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ulk4Q3V129 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ulk4Q3V129 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ulk4Q3V129 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ulk4Q3V129 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ulk4Q3V129 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ulk4Q3V129 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ulk4Q3V129 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ulk4Q3V129 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ulk4Q3V129 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ulk4Q3V129 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ulk4Q3V129 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ulk4Q3V129 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ulk4Q3V129 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ulk4Q3V129 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ulk4Q3V129 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ulk4Q3V129 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ulk4Q3V129 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Ulk4Q3V129 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ulk4Q3V129 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ulk4Q3V129 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ulk4Q3V129 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ulk4Q3V129 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ulk4Q3V129 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ulk4Q3V129 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms