Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc185Q3V118 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc185Q3V118 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc185Q3V118 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc185Q3V118 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc185Q3V118 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc185Q3V118 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc185Q3V118 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc185Q3V118 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc185Q3V118 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc185Q3V118 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc185Q3V118 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc185Q3V118 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc185Q3V118 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc185Q3V118 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc185Q3V118 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc185Q3V118 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc185Q3V118 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc185Q3V118 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc185Q3V118 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc185Q3V118 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc185Q3V118 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc185Q3V118 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc185Q3V118 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc185Q3V118 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc185Q3V118 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc185Q3V118 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc185Q3V118 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc185Q3V118 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc185Q3V118 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc185Q3V118 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc185Q3V118 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc185Q3V118 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc185Q3V118 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc185Q3V118 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc185Q3V118 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc185Q3V118 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc185Q3V118 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc185Q3V118 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc185Q3V118 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc185Q3V118 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc185Q3V118 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc185Q3V118 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc185Q3V118 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc185Q3V118 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc185Q3V118 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc185Q3V118 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc185Q3V118 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc185Q3V118 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc185Q3V118 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc185Q3V118 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc185Q3V118 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc185Q3V118 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc185Q3V118 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc185Q3V118 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc185Q3V118 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc185Q3V118 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc185Q3V118 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc185Q3V118 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc185Q3V118 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc185Q3V118 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc185Q3V118 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc185Q3V118 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc185Q3V118 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc185Q3V118 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc185Q3V118 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc185Q3V118 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc185Q3V118 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc185Q3V118 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc185Q3V118 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc185Q3V118 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc185Q3V118 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc185Q3V118 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc185Q3V118 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc185Q3V118 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc185Q3V118 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ccdc185Q3V118 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ccdc185Q3V118 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ccdc185Q3V118 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc185Q3V118 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc185Q3V118 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc185Q3V118 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc185Q3V118 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc185Q3V118 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc185Q3V118 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc185Q3V118 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc185Q3V118 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc185Q3V118 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc185Q3V118 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc185Q3V118 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc185Q3V118 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc185Q3V118 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc185Q3V118 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc185Q3V118 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc185Q3V118 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc185Q3V118 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc185Q3V118 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc185Q3V118 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc185Q3V118 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc185Q3V118 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms