Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZV7

UPF0577 protein KIAA1324-like homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UZV7 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q3UZV7 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q3UZV7 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q3UZV7 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q3UZV7 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q3UZV7 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q3UZV7 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q3UZV7 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q3UZV7 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q3UZV7 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q3UZV7 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q3UZV7 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q3UZV7 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q3UZV7 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Q3UZV7 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q3UZV7 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Q3UZV7 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q3UZV7 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q3UZV7 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q3UZV7 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q3UZV7 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q3UZV7 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q3UZV7 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q3UZV7 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q3UZV7 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q3UZV7 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q3UZV7 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q3UZV7 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q3UZV7 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q3UZV7 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q3UZV7 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q3UZV7 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q3UZV7 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q3UZV7 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q3UZV7 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q3UZV7 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q3UZV7 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q3UZV7 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q3UZV7 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q3UZV7 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q3UZV7 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q3UZV7 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Q3UZV7 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q3UZV7 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q3UZV7 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q3UZV7 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q3UZV7 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q3UZV7 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q3UZV7 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q3UZV7 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q3UZV7 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q3UZV7 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q3UZV7 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q3UZV7 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q3UZV7 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q3UZV7 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q3UZV7 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q3UZV7 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q3UZV7 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q3UZV7 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q3UZV7 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q3UZV7 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q3UZV7 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q3UZV7 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Q3UZV7 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Q3UZV7 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q3UZV7 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q3UZV7 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q3UZV7 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q3UZV7 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q3UZV7 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q3UZV7 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q3UZV7 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q3UZV7 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3UZV7 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3UZV7 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3UZV7 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3UZV7 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3UZV7 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3UZV7 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3UZV7 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3UZV7 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3UZV7 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3UZV7 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3UZV7 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3UZV7 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3UZV7 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3UZV7 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3UZV7 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3UZV7 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3UZV7 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3UZV7 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3UZV7 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3UZV7 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3UZV7 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3UZV7 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3UZV7 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3UZV7 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3UZV7 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3UZV7 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms