Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWA4

Trim40, Tripartite motif-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim40Q3UWA4 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim40Q3UWA4 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim40Q3UWA4 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim40Q3UWA4 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim40Q3UWA4 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim40Q3UWA4 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim40Q3UWA4 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim40Q3UWA4 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim40Q3UWA4 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim40Q3UWA4 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim40Q3UWA4 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim40Q3UWA4 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim40Q3UWA4 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim40Q3UWA4 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim40Q3UWA4 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim40Q3UWA4 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim40Q3UWA4 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim40Q3UWA4 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim40Q3UWA4 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim40Q3UWA4 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim40Q3UWA4 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim40Q3UWA4 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim40Q3UWA4 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim40Q3UWA4 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim40Q3UWA4 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim40Q3UWA4 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim40Q3UWA4 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim40Q3UWA4 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim40Q3UWA4 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim40Q3UWA4 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim40Q3UWA4 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim40Q3UWA4 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim40Q3UWA4 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim40Q3UWA4 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim40Q3UWA4 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim40Q3UWA4 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim40Q3UWA4 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim40Q3UWA4 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim40Q3UWA4 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim40Q3UWA4 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim40Q3UWA4 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim40Q3UWA4 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim40Q3UWA4 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim40Q3UWA4 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim40Q3UWA4 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim40Q3UWA4 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim40Q3UWA4 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim40Q3UWA4 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim40Q3UWA4 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim40Q3UWA4 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim40Q3UWA4 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim40Q3UWA4 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim40Q3UWA4 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim40Q3UWA4 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim40Q3UWA4 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim40Q3UWA4 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim40Q3UWA4 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim40Q3UWA4 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim40Q3UWA4 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim40Q3UWA4 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim40Q3UWA4 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim40Q3UWA4 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim40Q3UWA4 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim40Q3UWA4 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim40Q3UWA4 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim40Q3UWA4 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim40Q3UWA4 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim40Q3UWA4 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim40Q3UWA4 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim40Q3UWA4 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim40Q3UWA4 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim40Q3UWA4 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim40Q3UWA4 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim40Q3UWA4 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim40Q3UWA4 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim40Q3UWA4 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim40Q3UWA4 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim40Q3UWA4 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim40Q3UWA4 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim40Q3UWA4 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim40Q3UWA4 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim40Q3UWA4 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim40Q3UWA4 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim40Q3UWA4 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim40Q3UWA4 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim40Q3UWA4 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim40Q3UWA4 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim40Q3UWA4 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim40Q3UWA4 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim40Q3UWA4 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim40Q3UWA4 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim40Q3UWA4 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim40Q3UWA4 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim40Q3UWA4 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim40Q3UWA4 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim40Q3UWA4 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trim40Q3UWA4 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trim40Q3UWA4 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Trim40Q3UWA4 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trim40Q3UWA4 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms