Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW50

Gm27235, Predicted gene 27235, mousemouse

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm27235Q3UW50 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm27235Q3UW50 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm27235Q3UW50 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm27235Q3UW50 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm27235Q3UW50 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm27235Q3UW50 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm27235Q3UW50 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm27235Q3UW50 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm27235Q3UW50 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm27235Q3UW50 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm27235Q3UW50 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm27235Q3UW50 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm27235Q3UW50 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm27235Q3UW50 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm27235Q3UW50 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Gm27235Q3UW50 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm27235Q3UW50 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm27235Q3UW50 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm27235Q3UW50 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm27235Q3UW50 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm27235Q3UW50 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm27235Q3UW50 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm27235Q3UW50 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm27235Q3UW50 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm27235Q3UW50 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm27235Q3UW50 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm27235Q3UW50 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm27235Q3UW50 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm27235Q3UW50 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm27235Q3UW50 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm27235Q3UW50 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm27235Q3UW50 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm27235Q3UW50 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Gm27235Q3UW50 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm27235Q3UW50 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm27235Q3UW50 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm27235Q3UW50 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm27235Q3UW50 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm27235Q3UW50 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm27235Q3UW50 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm27235Q3UW50 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm27235Q3UW50 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm27235Q3UW50 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm27235Q3UW50 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm27235Q3UW50 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm27235Q3UW50 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm27235Q3UW50 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm27235Q3UW50 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm27235Q3UW50 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm27235Q3UW50 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Gm27235Q3UW50 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm27235Q3UW50 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm27235Q3UW50 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm27235Q3UW50 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm27235Q3UW50 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Gm27235Q3UW50 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm27235Q3UW50 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm27235Q3UW50 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm27235Q3UW50 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm27235Q3UW50 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Gm27235Q3UW50 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm27235Q3UW50 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm27235Q3UW50 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm27235Q3UW50 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm27235Q3UW50 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm27235Q3UW50 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Gm27235Q3UW50 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm27235Q3UW50 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm27235Q3UW50 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm27235Q3UW50 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm27235Q3UW50 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm27235Q3UW50 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm27235Q3UW50 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm27235Q3UW50 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm27235Q3UW50 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm27235Q3UW50 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm27235Q3UW50 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm27235Q3UW50 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm27235Q3UW50 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm27235Q3UW50 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm27235Q3UW50 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm27235Q3UW50 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm27235Q3UW50 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm27235Q3UW50 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm27235Q3UW50 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm27235Q3UW50 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm27235Q3UW50 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm27235Q3UW50 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm27235Q3UW50 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm27235Q3UW50 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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