Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW12

Cnga4, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga4Q3UW12 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cnga4Q3UW12 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cnga4Q3UW12 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cnga4Q3UW12 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cnga4Q3UW12 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cnga4Q3UW12 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cnga4Q3UW12 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cnga4Q3UW12 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cnga4Q3UW12 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cnga4Q3UW12 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cnga4Q3UW12 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cnga4Q3UW12 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cnga4Q3UW12 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cnga4Q3UW12 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Cnga4Q3UW12 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cnga4Q3UW12 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cnga4Q3UW12 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cnga4Q3UW12 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cnga4Q3UW12 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cnga4Q3UW12 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cnga4Q3UW12 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cnga4Q3UW12 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cnga4Q3UW12 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cnga4Q3UW12 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cnga4Q3UW12 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cnga4Q3UW12 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cnga4Q3UW12 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cnga4Q3UW12 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cnga4Q3UW12 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cnga4Q3UW12 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cnga4Q3UW12 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cnga4Q3UW12 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cnga4Q3UW12 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cnga4Q3UW12 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cnga4Q3UW12 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cnga4Q3UW12 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cnga4Q3UW12 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cnga4Q3UW12 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cnga4Q3UW12 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cnga4Q3UW12 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cnga4Q3UW12 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cnga4Q3UW12 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cnga4Q3UW12 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cnga4Q3UW12 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cnga4Q3UW12 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cnga4Q3UW12 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cnga4Q3UW12 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cnga4Q3UW12 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cnga4Q3UW12 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cnga4Q3UW12 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cnga4Q3UW12 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cnga4Q3UW12 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cnga4Q3UW12 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cnga4Q3UW12 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cnga4Q3UW12 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cnga4Q3UW12 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cnga4Q3UW12 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cnga4Q3UW12 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cnga4Q3UW12 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cnga4Q3UW12 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cnga4Q3UW12 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cnga4Q3UW12 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cnga4Q3UW12 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cnga4Q3UW12 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cnga4Q3UW12 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cnga4Q3UW12 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cnga4Q3UW12 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cnga4Q3UW12 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cnga4Q3UW12 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cnga4Q3UW12 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cnga4Q3UW12 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cnga4Q3UW12 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cnga4Q3UW12 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cnga4Q3UW12 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cnga4Q3UW12 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cnga4Q3UW12 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cnga4Q3UW12 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cnga4Q3UW12 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cnga4Q3UW12 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cnga4Q3UW12 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cnga4Q3UW12 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cnga4Q3UW12 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cnga4Q3UW12 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cnga4Q3UW12 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cnga4Q3UW12 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cnga4Q3UW12 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cnga4Q3UW12 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cnga4Q3UW12 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cnga4Q3UW12 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cnga4Q3UW12 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cnga4Q3UW12 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cnga4Q3UW12 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cnga4Q3UW12 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Cnga4Q3UW12 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cnga4Q3UW12 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cnga4Q3UW12 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cnga4Q3UW12 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cnga4Q3UW12 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cnga4Q3UW12 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cnga4Q3UW12 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms