Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKK2

Ceacam5, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 5, mousemouse

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ceacam5Q3UKK2 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ceacam5Q3UKK2 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ceacam5Q3UKK2 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ceacam5Q3UKK2 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ceacam5Q3UKK2 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ceacam5Q3UKK2 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ceacam5Q3UKK2 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ceacam5Q3UKK2 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ceacam5Q3UKK2 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ceacam5Q3UKK2 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ceacam5Q3UKK2 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ceacam5Q3UKK2 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ceacam5Q3UKK2 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ceacam5Q3UKK2 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ceacam5Q3UKK2 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ceacam5Q3UKK2 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ceacam5Q3UKK2 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ceacam5Q3UKK2 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ceacam5Q3UKK2 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ceacam5Q3UKK2 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ceacam5Q3UKK2 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ceacam5Q3UKK2 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ceacam5Q3UKK2 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ceacam5Q3UKK2 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ceacam5Q3UKK2 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ceacam5Q3UKK2 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ceacam5Q3UKK2 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ceacam5Q3UKK2 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ceacam5Q3UKK2 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ceacam5Q3UKK2 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ceacam5Q3UKK2 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ceacam5Q3UKK2 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ceacam5Q3UKK2 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ceacam5Q3UKK2 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ceacam5Q3UKK2 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ceacam5Q3UKK2 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ceacam5Q3UKK2 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ceacam5Q3UKK2 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ceacam5Q3UKK2 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ceacam5Q3UKK2 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ceacam5Q3UKK2 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ceacam5Q3UKK2 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ceacam5Q3UKK2 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ceacam5Q3UKK2 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ceacam5Q3UKK2 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ceacam5Q3UKK2 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ceacam5Q3UKK2 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ceacam5Q3UKK2 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ceacam5Q3UKK2 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ceacam5Q3UKK2 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ceacam5Q3UKK2 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ceacam5Q3UKK2 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ceacam5Q3UKK2 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ceacam5Q3UKK2 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ceacam5Q3UKK2 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ceacam5Q3UKK2 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ceacam5Q3UKK2 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ceacam5Q3UKK2 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ceacam5Q3UKK2 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ceacam5Q3UKK2 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ceacam5Q3UKK2 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ceacam5Q3UKK2 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ceacam5Q3UKK2 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ceacam5Q3UKK2 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ceacam5Q3UKK2 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ceacam5Q3UKK2 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ceacam5Q3UKK2 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ceacam5Q3UKK2 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ceacam5Q3UKK2 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ceacam5Q3UKK2 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ceacam5Q3UKK2 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ceacam5Q3UKK2 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ceacam5Q3UKK2 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ceacam5Q3UKK2 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ceacam5Q3UKK2 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ceacam5Q3UKK2 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ceacam5Q3UKK2 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ceacam5Q3UKK2 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ceacam5Q3UKK2 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ceacam5Q3UKK2 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ceacam5Q3UKK2 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ceacam5Q3UKK2 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ceacam5Q3UKK2 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ceacam5Q3UKK2 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ceacam5Q3UKK2 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ceacam5Q3UKK2 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ceacam5Q3UKK2 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ceacam5Q3UKK2 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ceacam5Q3UKK2 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ceacam5Q3UKK2 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ceacam5Q3UKK2 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ceacam5Q3UKK2 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ceacam5Q3UKK2 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ceacam5Q3UKK2 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ceacam5Q3UKK2 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ceacam5Q3UKK2 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ceacam5Q3UKK2 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ceacam5Q3UKK2 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ceacam5Q3UKK2 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ceacam5Q3UKK2 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms