Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc34Q3UI66 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc34Q3UI66 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc34Q3UI66 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc34Q3UI66 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc34Q3UI66 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc34Q3UI66 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc34Q3UI66 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc34Q3UI66 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc34Q3UI66 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc34Q3UI66 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc34Q3UI66 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc34Q3UI66 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc34Q3UI66 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc34Q3UI66 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc34Q3UI66 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc34Q3UI66 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc34Q3UI66 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc34Q3UI66 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc34Q3UI66 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc34Q3UI66 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc34Q3UI66 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc34Q3UI66 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc34Q3UI66 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc34Q3UI66 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc34Q3UI66 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc34Q3UI66 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc34Q3UI66 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc34Q3UI66 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc34Q3UI66 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc34Q3UI66 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc34Q3UI66 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc34Q3UI66 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc34Q3UI66 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc34Q3UI66 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc34Q3UI66 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc34Q3UI66 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc34Q3UI66 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc34Q3UI66 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc34Q3UI66 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc34Q3UI66 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc34Q3UI66 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc34Q3UI66 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc34Q3UI66 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc34Q3UI66 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc34Q3UI66 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc34Q3UI66 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc34Q3UI66 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc34Q3UI66 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc34Q3UI66 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc34Q3UI66 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc34Q3UI66 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc34Q3UI66 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc34Q3UI66 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc34Q3UI66 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc34Q3UI66 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc34Q3UI66 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc34Q3UI66 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc34Q3UI66 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc34Q3UI66 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc34Q3UI66 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc34Q3UI66 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc34Q3UI66 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc34Q3UI66 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc34Q3UI66 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc34Q3UI66 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc34Q3UI66 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc34Q3UI66 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc34Q3UI66 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc34Q3UI66 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc34Q3UI66 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc34Q3UI66 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc34Q3UI66 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc34Q3UI66 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc34Q3UI66 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc34Q3UI66 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc34Q3UI66 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc34Q3UI66 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc34Q3UI66 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc34Q3UI66 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc34Q3UI66 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc34Q3UI66 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc34Q3UI66 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc34Q3UI66 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc34Q3UI66 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc34Q3UI66 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc34Q3UI66 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc34Q3UI66 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc34Q3UI66 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc34Q3UI66 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc34Q3UI66 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc34Q3UI66 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc34Q3UI66 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc34Q3UI66 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc34Q3UI66 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc34Q3UI66 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc34Q3UI66 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc34Q3UI66 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc34Q3UI66 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc34Q3UI66 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms